索磷布韋是常用的泛基因型HCV聚合酶抑製劑,對目前已知的各型慢性HCV感染有效且在聚合酶上罕見有耐葯變異。但基因3型(GT-3)慢性HCV感染的患者對含索磷布韋的全口服直接抗病毒藥物方案的應答,相較於其他基因型HCV感染略差。根據英國學者近期在Gastroenterology雜誌上發表的一篇文章,GT-3a型病毒NS5B聚合酶部分氨基酸位點的置換可能與索磷布韋的治療失敗有關。
在這項研究中,研究者利用英國國民健康服務早期準入項目資料庫,收集了14份GT-3型患者的血清樣本,使用捕捉融合分析(Capture-Fusion assay)評估病毒對索磷布韋的敏感性,確定與應答降低相關的多態性,並創建了攜帶相關置換位點的修飾HCV及複製子,檢測其對索磷布韋和利巴韋林的敏感性。隨後,研究者在接受索磷布韋和利巴韋林聯合或不聯合聚乙二醇干擾素治療的GT-3型慢性HCV感染患者(411例)的獨立隊列中,通過Logistic回歸多變數分析,評估了這些多態性與持續病毒學應答(SVR)的相關性。
經研究發現,NS5B聚合酶第150位氨基酸置換(A→V)的GT-3a型病毒對索磷布韋的治療應答下降(病毒複製實驗),該置換見於42%的患者。在接受含索磷布韋方案治療的患者中,A150V變異與索磷布韋加利巴韋林±聚乙二醇干擾素的治療應答下降相關。該位點為V(纈氨酸)的326例患者的SVR為71%,而該位點為A(丙氨酸)的患者的SVR為88%。
細胞實驗顯示,出現A150V置換的病毒對索磷布韋的應答下降為原來的1/7。
除這個較常見的位點置換外,研究者還發現了206位點的一個罕見位點置換,該位點為谷氨酸(E)時病毒對索磷布韋的應答下降了8.34倍。若存在150位點和206位點的聯合變異,病毒對索磷布韋的應答下降35.77倍。
此外,研究者還在1例患者中發現了5個罕見的多態性,在細胞實驗中,這些多態性均顯著降低了病毒對索磷布韋的敏感性。