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健康報 | 無創DNA產前檢測期待「大顯身手」

3月5日凌晨,國際權威學術雜誌《自然》期刊《醫學遺傳學》發表了我國學者完成的一項重要研究成果,該研究為一項擴展性無創DNA產前檢測技術(NIPT Plus)覆蓋更多染色體異常疾病找到了強有力的證據;有望在產前出生缺陷防治工作中,促進擴展性胎兒遊離DNA(cfDNA)檢測的臨床應用,使更多染色體異常疾病的產前篩查成為現實。這一研究成果很快得到全球同行的高度關注和認可,引發了各界對無創DNA產前檢測的重視和期望。

出生缺陷防治——

產前篩查是一道重要「關卡」

2012年原衛生部發布的《中國出生缺陷防治報告》指出,我國的出生缺陷發生率約為5.6%,與世界中等收入國家平均水準接近;但由於人口基數大,每年新增出生缺陷病例總數龐大,達到約90萬例,已成為影響兒童健康和出生人口素質的重大公共衛生問題。中南大學醫學遺傳學研究中心、中國遺傳醫學中心主任鄔玲仟教授表示,出生缺陷病種繁多,目前已知的有8000種~10000種,主要由遺傳因素、環境因素及兩者相互作用引發。

目前,出生缺陷在發達國家已成為嬰兒死亡的第一位原因,這一趨勢在我國也逐漸顯現;出生缺陷也是兒童殘疾的主要原因,因治療、殘疾或死亡導致的疾病負擔巨大。根據2003年的資料測算,我國每年新出生的唐氏綜合征生命周期的總經濟負擔超過100億元,新發先天性心臟病生命周期的總經濟負擔超過126億元。

鄔玲仟教授表示,嚴重遺傳病是出生缺陷的主要原因,其新生兒發病率約為2%,主要由染色體異常綜合征(發病率約為1.6%)和嚴重單基因病(發病率約為0.4%)組成。染色體異常綜合征又分為常染色體非整倍體綜合征、性染色體非整倍體綜合征、染色體片段缺失/重複綜合征、染色體微缺失/微重複綜合征。

染色體是細胞核中載有遺傳信息的物質,主要由DNA和蛋白質組成。染色體的完整性對於任何生物來說都極為重要,染色體既不能多也能少,僅僅某條染色體的一小部分出現異常就可能導致致命的後果。唐氏綜合征就是人類21號染色體由正常的一對變為3條而導致的一種遺傳疾病,也稱21-三體綜合征;攜帶這種染色體異常的患兒,有明顯的智能落後、特殊面容、生長髮育障礙和多發畸形等,是最為常見的染色體異常導致的出生缺陷性疾病。我國唐氏綜合徵發生率約為14.7/萬,每年新增2.3萬~2.5萬例。

鄔玲仟教授表示,針對胎兒染色體非整倍體的產前篩查技術,主要包括血清學唐氏篩查、無創DNA產前檢測、超聲篩查3種。由於對醫生的操作技術具有很高要求,僅有少數大型三甲醫院能夠開展針對頸後透明帶等進行的超聲篩查,因此前兩種技術成為我國主要的篩查手段。

染色體異常篩查——

DNA檢測技術更接近疾病本質

血清學唐篩是一種通過檢測孕婦血清中的疾病相關蛋白濃度,並結合孕婦的體重、年齡和采血時孕周等因素,計算該孕婦生出先天缺陷胎兒的危險係數的檢測方法;主要的篩查缺陷包括21-三體綜合征、18-三體綜合征和神經管畸形。

血清學唐篩的高風險孕婦,需根據孕周大小選擇絨穿、羊穿、臍穿等穿刺操作,進行最終的產前診斷。鄔玲仟教授表示,儘管血清學唐篩是目前最主要的篩查手段,但中孕期三聯血清學篩查的檢出率僅在70%左右,且有高於5%的假陽性率,讓這一技術存在明顯的不足。

結合我國14.7/萬的唐氏綜合徵發生率,通俗地解釋一下前述兩個數字:在1萬名接受血清學唐篩的孕婦中,會有大約500名孕婦被告知為高風險,但接受穿刺診斷後,最終確診的真正唐氏兒只有9~10人;約98%高風險孕婦接受了不必要的穿刺,承受了一定的宮內感染和流產風險。此外,在篩查低風險、未接受穿刺診斷的孕婦中,約有4到6名唐氏兒被漏診。血清學唐篩技術的局限性,決定了每10個唐氏兒中約有3~4個會被漏診。

鑒於血清學唐篩並不理想的檢出率和陽性預測值,針對唐氏綜合征的篩查,尋找一項更加精準的產前篩查技術顯得尤為重要,無創DNA產前檢測(NIPT)應運而生。NIPT技術是基於大規模平行測序技術平台,通過對孕婦外周血中遊離胎兒DNA的檢測,發現來自21、18、13號染色體的遊離胎兒DNA片段含量的改變,進行胎兒常見染色體非整倍體異常的預測。

2012年,原衛生部全國產前診斷技術專家組就該技術進行了論證,認為NIPT是一種近於診斷水準的產前篩查新技術。有專家表示,NIPT可以準確鎖定靶向疾病的遺傳學病因,雖與血清學唐篩一樣,均取孕婦外周血血樣進行檢測,但其在檢出率、陽性率、陽性預測值方面均具有顯著的優勢,21-三體異常的檢出率可達98%~99%,而假陽性率僅為0.2%。這意味著,在1萬名接受NIPT檢測的孕婦中,僅有約1~2名孕婦需要接受不必要的穿刺診斷;在具有更高檢測準確性的同時,NIPT大大減少了由於侵入性產前診斷操作帶來的手術風險,完全可以取代傳統血清學唐篩。

據初步估算,NIPT進入我國市場以來,已為近1000萬名孕婦提供了檢測服務、檢出了數萬名三體綜合征患兒;儘管其具有極高的準確性和安全性,但與傳統血清學唐篩相比,服務數量仍遠遠不足,經濟因素成為其推廣受阻的主要原因。

目前,我國開展孕中期唐篩三聯法的收費一般在200元左右,而且已基本在各地納入財政補助或醫保報銷,個人實際負擔金額更低;而NIPT最初的收費標準普遍在2000元以上,且沒有相關財政補助或醫保報銷政策,但這一狀況應該得到改變。鄔玲仟教授曾針對兩種檢測技術,牽頭開展了一項衛生經濟學相關研究,結果顯示,綜合考慮因假陽性帶來的不必要穿刺診斷、漏診帶來的唐氏兒診療照護帶來的資源消耗等因素,只要例均收費控制在1620元以內,開展NIPT的社會經濟成本就會低於血清學唐篩,可以帶來更高的社會收益。目前,絕大多數地方的收費標準已經低於這一費用臨界點,廣東省深圳市已將NIPT納入醫保報銷。

貢獻中國智慧——

染色體異常篩查再解世界難題

事實上,導致唐氏綜合征的21-三體只是產前診斷髮現的全部染色體異常中的一部分,甚至21、18、13三大染色體三體的佔比也僅為1/4左右;其它的染色體異常問題同樣可導致嚴重的出生缺陷,需要在產前篩查和診斷中予以高度重視。

比如染色體微缺失/微重複綜合征(MMS)常見的臨床表現包括先天性畸形、器官功能障礙、生長髮育遲緩、智力殘疾、自閉症等。目前,已被發現的染色體微缺失/微重複綜合征有300餘種,綜合發病率遠高於唐氏綜合征的發病率;而且MMS大多為新發突變,其發生與孕婦年齡無關,常規產前檢測技術難以發現,將NIPT檢測範圍擴展至染色體微缺失/微重複,也是臨床的迫切需求。

專家表示,國際上對檢測MMS的探索從未停止。多個國家和地區的科研院所、臨床機構和檢測企業等已開展大量研究,但對以DiGeorge綜合征為代表的MMS檢測的陽性預測值均不理想,無法達到臨床一線應用的條件。直至不久前,本文開始所述的這項中國研究結果的發表,讓人們又重新燃起了希望。

實驗人員操作自動化工作站進行測序之前的文庫製備

該研究由中南大學醫學遺傳學研究中心、湖南家輝遺傳專科醫院、湖南省婦幼保健院、聯合我國一家創新型生物科技公司貝瑞基因共同完成。該研究招募了94085名自然受孕的檢測者,通過無創胎兒遊離DNA檢測並行篩查非整倍體綜合征、微缺失/微重複綜合征,結果顯示,在成本較低的低測序深度的基礎上,通過拓展性無創DNA產前檢測技術(NIPT Plus),不僅保持了非整倍體的高陽性預測值,而且對全基因組MMS也獲得了理想的陽性預測值,其中最常見的DiGeorge綜合征的陽性預測值達93%,遠超同期國際同類技術水準。

實驗人員使用高通量測序儀進行DNA測序

「NIPT技術亟待升級應用,但推廣至臨床應用必須有過硬的臨床研究數據支持,我們的研究成果得到了同行的高度肯定。」鄔玲仟教授表示,該領域的國際同行認為這一研究具有里程碑式的意義,「近10萬人的大樣本人群跟蹤隨訪為NIPT Plus作為臨床一線篩查技術提供了有力證據,為相關臨床指南的制定提供了有力支撐」。

貝瑞基因公司首席信息官於福利博士表示,染色體片段缺失/重複和MMS的致病性CNVs一般只有幾兆至幾十兆鹼基,片段較小;二代測序技術噪音較大,檢測基因拷貝數變異很難;孕婦外周血中胎兒DNA含量分布峰值較低、信號微弱等,都是NIPT技術應用於MMS檢測的技術難點。貝瑞基因利用PCR-free專利技術實現了較好的降噪效果,新的生物信息演算法極大優於其他演算法,加之臨床團隊和研發團隊緊密配合促進技術迭代,共同促成了此次技術和研究上的重大突破。

鄔玲仟教授表示,未來在更大範圍內實現NIPT及NIPT Plus技術在臨床的應用,還需要加強教育宣傳工作,讓百姓和醫務人員都能意識到NIPT篩查的重要意義;還要加強產前診斷中心的服務能力建設,NIPT Plus技術將覆蓋眾多的染色體異常疾病,要提高醫務人員對這些疾病篩查的辨識能力;同時要嚴格篩查技術開展的質量控制和規範管理。「NIPT Plus技術相關研究的例子,很好地說明了國家提倡的產學研一體化,非常有利於科技和產業的發展,最終造福老百姓」。


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