孤獨症譜系障礙(autism spectrum disorder,ASD)是一組個體差異非常大的全身性疾病,發病因素包括遺傳、環境、代謝等。由於個體差異大,存在不同的亞群,目前ASD的診斷主要基於行為特徵,沒有統一的生物標誌物。尋找生物標誌物一直是迫切需要解決的難題,代謝組學研究有助於揭示ASD患者存在的代謝異常,以尋找可靠的生物標誌物來幫助診斷。
兒童孤獨症代謝組計劃(Children』s Autism Metabolome Project ,CAMP)是該研究小組開展的用於研究ASD代謝異常亞群的一個大型項目,美國CAMP招募了1100名患有ASD、智力障礙以及典型發育的幼兒(18-48個月)。
研究發現,部分ASD個體中存在氨基酸代謝失調,支鏈酮酸脫氫酶激酶基因(BCKDK)功能突變會導致ASD個體血清支鏈氨基酸的降低。為確定氨基酸代謝失調在ASD中是否具有普遍性,以及該代謝特徵能否作為ASD代謝亞型用於區分其與典型發育兒童,研究小組開展了ASD氨基酸代謝失調的研究。
研究方法
樣本量:
訓練集:253名ASD兒童,85名典型發育兒童;測試集:263名ASD兒童,79名典型發育兒童。
用高效液相色譜-質譜聯用儀測量兒童血清中的氨基酸水準,採用機器學習的方法篩選生物標誌物,並確定生物標誌物的診斷閾值,計算特異度、靈敏度和陽性預測值。
研究結果
1.人口統計學特徵
訓練集和測試集中ASD患病率、發育商、性別組成均無顯著性差異,分析發現性別和年齡對代謝物水準有輕微影響。
2.ASD中氨基酸之間的相關性分析
如下圖黃框中所示,支鏈氨基酸簇(BCAA)和甘氨酸簇(Gly)的氨基酸之間存在顯著負相關,因此選擇甘氨酸簇氨基酸/ 支鏈氨基酸簇氨基酸的比值作為生物標誌物。
3.利用比值(甘氨酸簇:支鏈氨基酸簇)鑒別ASD相關的氨基酸代謝失調亞型
通過機器學習的方法在訓練集中建立該比值的閾值用於區分ASD和典型發育兒童,在測試集中測試所確定閾值的診斷效果。如下表所示,谷氨醯胺:支鏈氨基酸(Gln:BCAA),甘氨酸:支鏈氨基酸(Gly:BCAA),鳥氨酸:支鏈氨基酸(Orn:BCAA),這三者作為生物標誌用於區別ASD和典型發育兒童具有較高的靈敏度、特異度和陽性預測值。三組標誌物結合作為判斷標準,共診斷出總樣本中16.7%的ASD,特異度為96.3%,陽性預測值為93.5%。
研究意義
氨基酸代謝失調亞型生物標誌物的確立為早期診斷ASD提供了一種途徑,有利於早期發現,及時乾預。
參考文獻:Smith, A.M., et al. Amino Acid Dysregulation Metabotypes: Potential Biomarkers for Diagnosis and Individualized Treatment for Subtypes of Autism Spectrum Disorder. Biol Psychiatry 85, 345-354 (2019).