FDA批準的癌症基因檢測和你做的基因檢測有什麼不同？

美國FDA曾發布警告，目前市面上不同基因檢測結果存在較大差異。一方面，不同公司相同產品檢測結果存在差異，這可能來自於測序原理或測序體系設計，生物資訊演算法等差異；另一方面，同一產品的檢測結果在不同臨床機構解讀標準存在差異，這可能來自於對同一具有臨床意義或具有潛在臨床意義的基因理解或治療方式存在差異。如Brca基因檢測結果解讀，不同企業或不同臨床機構在解讀規則和解讀能力上存在差異。

FDA批準的兩款癌症基因檢測

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2017年11月15日，美國FDA宣布，已批準紐約紀念斯隆·凱特琳癌症研究中心（Memorial Sloan Kettering Cancer Center，MSK）基於二代測序技術（NGS）的癌症基因檢測分析平台MSK-IMPACT，為癌症基因檢測未來的學術研究及商業開發開創了先河，進一步拓寬了個體化醫療的路線。

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2017年11月30日，FDA批準了Foundation Medicine旗下產品--FoundationOne CDx（F1CDx）用於泛癌症臨床伴隨診斷，這是首款突破性的NGS伴隨診斷產品，能對任何實體腫瘤進行診斷，在體外診斷領域具有裡程碑式的意義。F1CDx覆蓋324個基因的遺傳突變以及兩類基因組特徵，能夠高效檢測腫瘤基因的SNV、Indel、MSI以及TMB等。通過與FDA之前批準的伴隨診斷對比，F1CDx的總體準確率可達到94.6％。

我們看到FDA批準了MSKCC的的二代測序平台被FDA批準作為腫瘤檢測的補充診斷。該平台可以檢測468個基因突變，及其他分子變化。這可以說是一次重要事件，而Foundation Medicine的平台作為伴隨診斷，可以說是腫瘤精準治療的一個裡程碑，那麼這兩款基因檢測到底有什麼區別呢？

首先，伴隨診斷（CDx）是對於接受相應的藥物治療必須進行的檢測，也就是金標準！而補充診斷則對於接受響應藥物治療不是必須的檢測，但可以提供治療的相關資訊。

其次，這兩款基因檢測在檢測類型和臨床用途都有明顯的差異：

美國FDA授予上市，充分說明美國FDA認可該產品檢測性能的同時也認可了該機構對結果的綜合分析能力。

但是從臨床獲益的角度上看，FoundationOne CDx（F1CDx）更優，並且美國CMS通過對其進行醫保覆蓋。

FDA批準的首款泛腫瘤全基因組測序！

FoundationOne CDx 是首個獲得 FDA 批準的針對泛腫瘤的全面的伴隨診斷檢測，324個基因、兩個可以預測免疫檢查點抑製劑療效的分子標記（MSI/TMB）、覆蓋全部實體瘤（除肉瘤）、直接對應FDA批準的17個靶向治療方案！

能夠：

• 評估能夠驅動腫瘤生長的已知的324個基因的所有四類基因突變類型，從而為臨床決策提供資訊支持；

• 根據患者個體的基因狀況，識別可能會對靶向療法產生應答的進展期癌症患者；

• 報告基因組信號，包括微衛星不穩定性（MSI）和腫瘤突變負荷（TMB）,同時報告（與其它治療相關的）其它基因的基因變異，供醫生用於患者管理。

對於多腫瘤靶標的綜合突變分析產品，卓越地檢測分析性能評估及前期大規模臨床數據確認是必要的前提，資料庫的構建和參考文獻的組織管理，以及知識庫的使用和更新應有明確關聯性；測序數據分析處理及結果的綜合分析能力也顯得尤為重要。美國FDA授予Foundation Medicine該產品上市，充分說明美國FDA認可該產品檢測性能的同時也認可了該機構對結果的綜合分析能力。

Foundation 為什麼這麼牛？

Foundation Medicine公司成立於2010年，擁有史上最豪華的專家團隊和明星投資者。

其創始之一是埃裡克·蘭德爾（Eric Lander），他曾經是人類基因組計劃（Human Genome Project）的長官成員，當之無愧的「走在基因研究領域最前端的人」。

2011年Google為其投資。

「對人類基因組的理解正在劇烈影響幾乎所有的醫學領域。Foundation Medicine正在利用基因組數據的力量來改善對癌症的治療，這將是十分重要的一步。我很高興能夠成為它的支持者。」

這是2013年，比爾蓋茨在Foundation Medicine結束B輪投資之後採訪中說的話。

NCI（美國國家癌症中心）特指定與全球最頂尖的癌症基因測序公司Foundation Medicine合作，旨在協助NIC正在執行的癌症探月計劃和癌症精準治療研究計劃。

2017年6月7日，Foundation與美國國家癌症研究院（NCI）達成協定，協助NCI-MATCH試驗計劃1100個臨床實驗基地進行基因檢測，並宣布向美國NCI公開18000名癌症患者基因資訊，這些資訊來自FoundationCORE? 資料庫。這是迄今為止輸送給NCI的最大的一次基因數據，是NCI現有資料庫的兩倍。

喬布斯患癌之後，也曾經使用過Foundation Medicine的基因檢測技術，花費十萬美元，但終究沒有挽回生命。不過，喬布斯認為這樣的檢測很有意義。他在接受《麻省理工科技評論》採訪時曾表示：「我要麼是第一批以這種方式擊敗癌症的人，要麼是最後一批死於癌症的人。」

FoundationOne CDx與國內的基因檢測有何區別？

十數年的發展中，FoundationOne CDx作為研究工具協助無數科研成果的發現，在這個過程裡也積累了大量的數據。

其獨有的資料庫FoundationCore是目前世界上最大的癌症基因組資料庫之一，擁有超過18萬患者的數據記錄；同時也與50家以上的生物製藥企業合作，幫助加速新的靶向藥物研發，科研成果匯總成340多篇科研論文。

來源：FoundationMedicine官網

在這些數據的基礎上，FoundationOne CDx能夠覆蓋到全部實體瘤、324個重要基因，特別是針對非小細胞肺癌、黑色素瘤、乳腺癌、結直腸癌、卵巢癌五大癌種，17中FDA批準的靶向療法中，12種是指南推薦的一線療法。

FoundationOne CDx改善了傳統方法（ICH/FISH的局限性），可以為患者推薦更多的靶向治療方案。

以肺癌為例，在標準基因組檢測陰性的NSCLC中，癌症綜合基因檢測發現其中65%存在可指導臨床診療的基因突變 。

26%是診療指南中有靶向療法的突變

39%是臨床試驗中有靶向療法的突變

29%是暫時沒有任何靶向療法的突變

6%沒有發現任何基因突變

超過30%攜帶ALK基因融合的非小細胞肺癌患者，FISH檢測結果卻為ALK陰性 。而在FISH檢測陰性的患者中，70%在克唑替尼治療後獲得緩解，這也確認了FISH檢測漏掉的ALK重排是一個腫瘤驅動突變。

除此之外，FoundationOne CDx還可以計算微衛星穩定性（MSI）和腫瘤突變負荷（TMB）兩種分子標記，可以作為癌症治療、特別是免疫治療的參考。

值得一提的是，在全球腫瘤醫生網查閱的大量文獻中，一些新藥物的臨床試驗涉及到的基因檢測報告，均是由Foundation提供的，比如LOXO-101，甚至開發了專門針對該類藥品的NTRK融合檢測，想了解的患者可以致電全球腫瘤醫生網醫學部顧問。

Foundation得到全美知名癌症中心如MD安德森癌症中心、紀念斯隆凱瑟琳癌症研究院、丹娜法伯癌症研究院、麻省總醫院等全球知名癌症機構的青睞和認可，這些專家都會推薦患者接受foundation的基因檢測，並肯定foundation的檢測結果！據說，由於F1CDx在基因檢測方面的優勢，美國醫療保險和醫療補助服務中心（CMS）將會對F1CDx檢測提供補助。也就是說：F1CDx檢測進了美國醫保，將為約百萬美國患者提供精準的基因檢測服務。

關於Foundation，患者需要了解的5個問題

國內基因檢測機構幾百家，良莠不齊。由於工作需要，全球腫瘤醫生網每天都會接到患者發來的基因檢測報告，希望專家給予解讀。這些基因檢測報告個別是國內大公司的，絕大部分是各地小公司製作的報告。從報告內容上分析看，大部分公司僅能依靠公開的數據進行檢測數據解讀，推薦靶向藥物，未能根據患者具體情況進行個體化分析，甚至，推薦的臨床試驗也是從臨床試驗官網clinicaltrials.gov上隨機挑選一些。這樣的檢測報告不能全面解讀患者的基因檢測結果的意義，也不能為患者指定個體化治療方案，既浪費了癌症患者的救命錢，也耽誤了治療的時間。

全球腫瘤醫生網醫學專家鄭重提醒癌症患者，如果決定做基因檢測，一定要選擇權威的基因檢測公司，如國內的泛生子、燃石、世和等，不同水準的基因檢測公司從檢測設備、數據分析、專家團隊、臨床匹配等各個方面都具有天壤之別。

對於經濟條件較好的患者，我們也會建議首選美國凱瑞思或foundation基因檢測，這兩家公司是全球首肯的研究機構，隨時更新基因研究成果、靶向藥物和最新臨床試驗。

一次高品質的全基因組測序能讓患者在腫瘤治療中全程受益！每年美國FDA都會有針對新靶點的新藥物和臨床試驗獲得批準，這些治療機會只能通過最頂尖的檢測機構獲得。

我們有很多位患者先後接受了國內某基因檢測公司全基因檢測和美國權威基因檢測的報告對比分析，國內外檢測水準天壤之別一看便知，想了解的患者可以登錄全球腫瘤醫生網的官網或致電了解。

廣義上講，所有腫瘤患者均可以接受基因檢測；狹義上講，根據指南推薦，不同的病種、不同的分期、出於不同的目的，不同的患者，適合做不同的基因檢測。

比如，一個晚期肺腺癌患者，尚未接受任何治療，家庭經濟情況一般，只是為了看看，是否有合適的已經在內地上市的靶向葯可用，那麼只要測一下最常見的那幾個基因就可以了。

比如，一個超級土豪，是一個肉瘤，其他藥物治療都失敗了，但是依然想碰碰運氣，看看是不是自己還有靶向葯可用：不管是已經上市還是處於臨床試驗研究階段的，不管是國內還是國外，都想知道。那麼，他或許可以選擇做一下跨癌種的、儘可能多的、幾十上百甚至全部的基因。

但是，在癌症的治療過程當中，有一部分人在接受靶向治療前，選擇不做基因檢測，而這種治療方法就叫做盲試。對比基因檢測，盲試也有自己的優勢，比如即能省錢又能節省時間。那麼到底什麼情況才可以跳過基因檢測，直接進行靶向治療呢？

1、靶向藥單一：一些種類的癌症，可能突變類型比較單一，對於靶向葯也沒有可選餘地，這種情況下，可以選擇盲試，一旦發現沒有效果，就需要更他療法。

2、生存期不樂觀：對於一些癌症友友，可能醫生的預估不足6個月，並且經濟條件也不好，這種情況，如果拿半個月等一個不確定的結果的話，就顯得太冒險，所以不如直接進行盲試，把錢用在刀刃上，挑選概率最大的進行嘗試，俗稱「闖大運」。

當然盲試也有著自己的短板，在沒有基因檢測之前，用藥基本靠「猜」，而效果也基本靠「祈禱」，所以在治療的過程中，對於是否進行靶向治療，大家可以在顧問主治醫生或全球腫瘤醫生網後慎重決定。

之前，國內的患者想要接受美國的基因檢測，需要將切片千里迢迢寄到美國，

但從今年8月起，FoundationOne?CDx經歷了技術轉移、實驗室準備、臨床樣本驗證和生信團隊培訓等一系列工作後，終於可以在國內大展身手了，現在中國患者也能夠使用上最新的技術。

1、患者提供近期病歷資料及病理報告，6-8微米厚的組織切片10-15張 (未染色)；1張同部位的染色切片；

3、收到資料及組織切片後，15~20個工作日出具檢測報告；

4、Foundation基因檢測公司出具基因檢測報告；

5、全球腫瘤醫生網協助患者確定下一步治療方案（協助患者來北京三甲醫院治療，治療方案由北京專家決定）......

在已經進行的上萬例檢測中，有82%的檢測結果後來被用於實際的治療中，包括：

1. 找到一個已經批準的、針對患者腫瘤基因改變的治療措施；

2. 找到一種已經批準用於相同基因改變的其它類型癌症的新葯，這樣的藥物很可能對患者的腫瘤也有顯著療效；

3. 找到一個臨床試驗，所使用的試驗藥物儘管不直接作用於患者腫瘤發生改變的那些基因，但作用於相關的信號通路，因而也可能會有很好的療效。

以前，醫生是依靠比較患者對不同治療藥物的隨機對照試驗結果決定哪一種藥物有效。

然而，過去大多數試驗研究是根據癌症病理類型和分期做的，而不是通過癌症生物標誌物分類做的。問題在於相同類型和分期的患者可能對同樣的治療反應不一樣。在同一部位發生的癌症可能是由於不同的分子機理導致的，所有對治療的反應肯定不一樣。

今天，新的研究表明癌症基因檢測可以確定這些分子學改變，並且與特定的治療方法相關。癌症治療指南和規範正在改變，將分子學檢測作為癌症治療的基礎，但是很難將最新的研究成果納入其中。

基因檢測可以幫助你的醫生評價潛在的治療選擇。

基因檢測可以：

1、 幫助你的醫生明確你最有可能對哪種治療藥物有效。

2、 幫助你的醫生確定你最不可能對哪種藥物有效。

3、 幫助你的醫生明確他以前未曾考慮過的治療藥物。

4、 幫助患者和醫生指導治療和發現新的治療方法（異病同治）。

5、 幫助你在沒有治療方案選擇時推薦最能獲益的臨床試驗。

結語

無論是靶向治療的方案指導，還是免疫治療的療效預測，Foundation One CDx檢測都擁有非常大的優勢。對於正在飛速發展的腫瘤精準治療而言又邁上了一個新的台階。最重要的是，F1CDx的適應症為所有實體瘤患者，也就是說對大部分患者而言，F1CDx都是適用的。

基因檢測的重要性不言而喻，精準的基因檢測是精準治療方案的前提。作為國內權威的腫瘤患者診療服務平台，全球腫瘤醫生網在過去幾年協助國內眾多癌症患者接受美國foundation基因檢測，如今，國內患者想要接受檢測更加便捷，通過全球腫瘤醫生網申請，2周即可拿到權威基因檢測結果。詳情可致電全球腫瘤醫生網醫學部。