懷孕後，孕媽咪體內酶會有一定的改變，對於某些藥物的代謝過程有一定的影響。藥物不易解毒和排泄，可有蓄積性中毒，在孕早期胎兒器官形成時，對胎兒可產生影響。
瀋陽九州家圓醫院的專家表示：但萬事都是一分為二，孕婦用藥有一定的風險，並不是完全無益。一些疾病本身對胎兒、母親的影響遠遠超過藥物的影響，這時，就應權衡利弊，在醫生指導下，合理用藥。
用藥與胎齡
胎齡與藥物致畸有著緊密聯繫。胚胎或胎兒在不同的發育階段對藥物的敏感性不同，而且藥物對不同時期的胎兒造成的危害程度也不同。一般可將胎兒的發育分為3個階段。
第1階段：受精後2周內
由於胚胎細胞尚未分化，細胞的功能活力相等，對藥物表現出無選擇性，胚胎受損後可能造成的後果只有兩種，一是胚胎受損嚴重，造成胚胎死亡而發生早期流產；二是受損不嚴重，胚胎仍能存活發育成正常個體。
第2階段：懷孕3周～12周
此時是胚胎各組織分化最活躍的時期，也稱致畸敏感期。有些藥物可能干擾某部分胚胎的分化與組織器官的形成，有的可能造成流產，有的進一步發育導致畸形。
胚胎不同組織器官在不同的發育階段對藥物的敏感性也不同，如引起「海豹兒（四肢短小）」的藥物反應致畸敏感期為受精後的21天～40天；唇、牙、齶的畸形敏感期在妊娠的5周～8周內，而心臟是3周～6周。
第3階段：懷孕12周以後
妊娠12周後，組織器官分化大體完成，造成畸形的可能性相對較小，但此時胎兒仍在快速生長髮育，若用藥不當仍可能影響胎兒的生長與器官功能的發育，導致胎兒耳聾、失明、智力低下，甚至死胎。
孕期藥物按照對胎兒的不良影響是分五型的，A和B型都可以用，如維生素、鈣片和青黴素頭孢類等。C型用藥需諮詢醫生，權衡利弊後使用。D型以上藥物原則上孕期禁用。孕期所有用藥都需經過醫生指導。
目前我國對孕婦的用藥借用了美國藥物和食品管理局制定的標準，按藥物的不同危害分級如下：
?A級藥物
對孕婦安全，對胚胎、胎兒無危害，如適量維生素A、維生素C、維生素D、維生素E等。
?B級藥物
對孕婦比較安全，對胎兒基本無危害，如青黴素、紅霉素、地高辛、胰島素等。
?C級藥物
僅在動物試驗研究時證明對胎兒致畸或可殺死胚胎，未在人類研究中證實，孕婦用藥須權衡利弊，確認利大於弊時方能應用，如慶大黴素、異丙嗪、異煙肼等。
?D級藥物
對胎兒的危害有確切證據，除非孕婦用藥後有絕對效果，否則不考慮應用，如硫酸鏈黴素（使胎兒第8對腦神經受損、聽力減退等）、鹽酸四環素（使胎兒發生齶裂、無腦兒等）等要在萬不得已時才使用。
?X級藥物
可使胎兒異常，在妊娠期間禁止使用，如甲氨蝶呤（可致胎兒唇裂、齶裂、無腦兒、腦積水、腦膜膨出等）、乙烯雌酚（可致陰道腺病、陰道透明細胞癌）等。在妊娠前3個月，以不用C、D、X級藥物為好。當孕婦出現緊急情況必須用藥時，也應盡量選用經臨床多年驗證無致畸作用的A、B級藥物。
依據母胎狀況用藥
由於醫師的專業領域不同，可能會有用藥上的疑慮，建議諮詢婦產科醫師，確認是否適用。醫師舉例，曾有孕媽咪長期使用利尿劑控制心血管疾病，該款「利尿劑」屬於D級藥物，但是它並非會致畸胎，而是易使子宮的血流量減少或電解質不平衡，可能造成胎兒的血流供應不足等問題。然而，有些孕媽咪可能因為本身有心血管或腎臟方面等疾病，需要以利尿劑來控制，此時要先了解藥物性質與母胎狀況，並酌情使用，並非看到分級制度就過度緊張。若孕媽咪因為害怕用藥而無法正常飲食作息，反而可能造成胎兒的健康問題。
患有慢性疾病或特殊情況的孕媽咪，例如：憂鬱症、紅斑性狼瘡、甲狀腺亢進、高血壓、糖尿病等，建議考慮由原本長期就診的醫師，搭配該院的婦產科醫師，隨孕期進展交換意見，幫助孕媽咪控制病情，掌握母胎健康。孕媽咪常常害怕自己會影響到寶寶，但其實只要有正確的觀念，並且依照醫師指示服藥，大都能孕育出健康的寶寶，並且安全度過孕期。醫師提醒，孕媽咪要避免自行減葯或停葯，由於胎兒會造成媽咪的血液、循環和體重增加，藥量的比例也可能需要調整，因此藥量的增減必須諮詢長期照護的醫師。
孕期用藥注意原則
1、孕婦不要隨便使用非處方葯，一切用藥都應在醫生指導下進行；
2、應選擇對胚胎、胎兒危害小的藥物；
3、應按照最少有效劑量、最短有效療程使用，避免盲目大劑量、長時間使用，避免聯合用藥；
4、非病情必需，盡量避免在妊娠早期用藥；
5、如可以局部用藥有效的，應避免全身用藥；
6、用藥前應詳細閱讀《藥物說明書》，盡量不用「孕產婦慎用」和「孕產婦禁忌」的葯；
7、如母親的疾病使胎兒染病時，應選用胎兒、羊水的藥物濃度與母體的藥物濃度相接近的安全的藥物，母子同治；
8、應使用多年廣泛應用於孕婦的藥物，盡量避免使用尚難確定對胚胎、胎兒、新生兒有無不良影響的藥物，僅有理論上評價的藥物慎用；
9、近臨產期或分娩期用藥時，要考慮藥物通過胎盤而對生產時的胎兒及出生後的新生兒的影響；
10、可以通過DNA檢測技術來區別、掌握在此期間能夠安全使用何種藥物。
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