科技快遞丨 多次妊娠或使細胞衰老速度加快

科研進展

1、Nat Genet：中國農大團隊成功組裝Mo17參考基因組

《Nature Genetics》，中國農大賴錦盛團隊利用單分子測序和BioNano對玉米骨乾自交系雄性代表系Mo17進行de novo組裝，96.4%的組裝序列被定位到各條染色體上，預測了38620個蛋白編碼基因。通過比對B73和Mo17基因組，發現了近987萬個SNP，142萬個小的indels（長度短於100bp），並在兩個代表性的玉米基因組間存在超過25MB的存在/缺失變異序列。該研究提供了玉米種質的高品質參考基因組，鑒定的種內基因順序和基因結構變異可對雜種優勢和基因組進化提供重要的價值資源。

2、Nat Genet：玉米W22參考基因組發布

《Nature Genetics》，山東農大、明尼蘇達大學和愛荷華州立大學等國際聯合團隊利用短讀長測序（>?180×）和10×?genomics對W22參考基因組進行測序和從頭組裝，組裝基因組大小2.13G，Contig N50為72K，Scaffold N50為35.5Mb。與B73參考基因組比較，發現W22在轉座子組成、拷貝數變異到單核苷酸多態性方面存在顯著的結構異質性。該參考基因組能準確定位數千個Mutator（Mu）和Dissociation（Ds）轉座子元件插入物，可用於反向和正向遺傳學研究。利用RNA-seq對基因組進行注釋，差異核酸酶敏感性分析和亞硫酸氫鹽測序分別繪製開放閱讀框，開放染色質位點和DNA甲基化譜。該研究將W22整合為功能基因組學的參考基因組，並為玉米泛基因組研究提供了基礎。

3、鑒定出2型糖尿病的143種風險變異，並推斷出潛在的調節機制

《Nature Communications》，研究人員對62892例2型糖尿病（T2D）病例和596424例歐洲血統對照進行全基因組關聯研究（GWAS）並進行薈萃分析，發現約1600萬個遺傳變異，鑒定了與T2D相關的139種常見和4種罕見變異，其中42種（39種常見變異和3種罕見變異）是新發現的。將來自血液的基因表達數據與GWAS結果整合，鑒定了33個假定的T2D功能基因，其中3個是被批準的靶向藥物。進一步整合DNA甲基化和表觀基因組注釋數據，發現CAMK1D，TP53INP1和ATP5G13個基因具有合理的調控機制，遺傳變異可通過基因表達的表觀遺傳調控對T2D發揮作用。該研究提出了T2D的假定遺傳調控機制，並提供了T2D相關變異純化選擇的證據。

4、多次妊娠可能使細胞衰老速度加快

《Scientific Reports》，美國西北大學和華盛頓大學研究團隊通過觀察有多次生育史的年輕女性的端粒長度和表觀遺傳年齡，發現多次妊娠可能會使女性的細胞衰老速度更快。每懷孕一次，細胞衰老速度加快0.5-2年。此外，懷孕中女性的細胞看起來比預期的要年輕。儘管女性的生理年齡隨著生孩子增高，但是懷孕中女性的表觀遺傳年齡和端粒長度，比實際年齡看起來年輕。研究人員從歷史記錄和流行病學研究中了解到，多次生育的女性與無生育史的女性相比，壽命往往稍短一些，也更容易發生各種疾病。儘管有充分的證據表明，多次生育，尤其是超過4、5次生育，會增加某些疾病的風險，甚至縮短壽命。研究人員認為懷孕期間細胞變化可能與母親免疫系統的適應性變化有關。

1、Illumina公布2018Q2財報，同比增長25%

Illumina公布2018Q2財報：Q2營收約為8.3億美元，相比去年同期的6.62億美元，增長了25%。其中，產品收入為6.73億美元，服務和其他收入為1.57億美元。與2017年第二季度相比，測序耗材、晶元耗材、實驗室和其他服務均超過30％增長。研發費用達到1.51億美元，增長了16％。

2、自然科研與養樂多攜手支持人體微生物群研究

近日，自然科研與養樂多針對人體微生物群研究，發起了一個全新的多年度競爭性資助項目「全球腸道健康研究資助金」，將考慮各種科研項目提案，包括實驗室調查或臨床研究，旨在增進人們對腸道微生物群健康影響的了解。首輪資助將於8月向全球科研人員開放申請。每輪資助設有3個獎項，總額達10萬美元。研究項目期限為一年。申請人應就職於大學、研究所或其他任何非營利性機構，必須擁有專業或研究學位（如哲學博士、醫學博士和藥學博士），具備至少5年的博士後研究經歷。相關申請領域包括：人體微生物群的結構、功能和多樣性；腸道相關免疫系統和微生物群的免疫調節能力；腸道微生物群和營養在炎症性疾病與代謝疾病中的作用，例如肥胖症、炎症性腸病和腸道易激綜合征；微生物群在腸—腦軸中的作用；腸道微生物群的調節。

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