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腫瘤基因檢測技術具體應用在癌症治療哪個方面?

腫瘤基因檢測技術的應用,建立在實驗技術之上,首先通過實驗室檢測出相應需求的數據,然後對基因數據進行解讀。

治療癌症時,對腫瘤基因檢測結果的解讀與應用,主要體現在以下5方面:

1、癌症早篩|腫瘤早期篩查

2、癌症遺傳|腫瘤易感基因檢測

3、靶向用藥基因檢測|靶向用藥伴隨診斷

4、化療藥物療效檢測

5、基因檢測數據解讀|用藥參考

1、癌症早篩|腫瘤早期篩查

人體中的腫瘤癌細胞增殖、分裂、生長、發展是以指數速度進行的,早期發現的腫瘤隱患和晚期癌症預後有巨大的差別,生存機會天地之別,所以對癌症隱患的排查,是治療癌症的重中之重,早發現,早治療。

癌症早篩在技術方面的要求就是基因檢測的靈敏度和特異性,其中靈敏度要求排在第一優先順序。

在基因層面,腫瘤是各不相同的。肺癌和乳腺癌不同,肺癌和肺癌不同,同一個肺癌患者有在不同階段也不同,同一個肺癌患者在同一階段,不同的腫瘤細胞也不同。因為目前醫學界和工工程界仍然無法很好地解決腫瘤異質性的問題,目前還沒有辦法通過找到某個基因或某組基因目標,通過檢測它,就能下結論說是已經發生癌症。所以臨床上用於早期篩查的腫瘤基因檢測項目,仍然是通過常規檢查配合基因檢測的方式在進行。

癌症早期篩查目前常規採樣為外周靜脈血。原理是如果身體中有隱匿的腫瘤病變組織,外周血當中存在遊離的ctDNA,但如果屬於早期病變,ctDNA含量可能極其微少而難以檢出,需要

這就回到了另一個技術層面的難點,即使身體存在隱匿的腫瘤病灶,外周血當中ctDNA的含量可能是極其微少,導致難以檢測出來。為了提高腫瘤檢出率,必須使用專項樣本,比如使用糞便樣本,對消化系統腫瘤進行針對性檢測,但對其他的腫瘤這個樣本就沒什麼作用。

所以面對這樣的限制條件,百配健康的建議是在45歲前後,可考慮以下5個方面的針對性項目檢測。

(1)長期吸煙的男性,檢測是否有肺癌隱患。

(2)長期喝酒的男性,檢測是否有肝癌隱患。

(3)女性主要針對乳腺癌和卵巢癌進行針對性早篩。

(4)長期喝涼茶和愛吃補藥的人群,可針對腎癌進行早篩。

(5)常吃辛辣/高溫/醃臘製品的人群檢測是否有咽喉、食道、胃腸等消化系統腫瘤。

2.癌症遺傳|腫瘤易感基因檢測

癌症的發生與發展,是一個外部環境與機體內環境共同作用的結果。腫瘤具有遺傳易感性,但不同的基因、不同的腫瘤,這種影響程度大不相同。這種檢測目前醫學界已經積累了一定的臨床數據,對檢測數據的解讀是癌症是否遺傳的核心點。

比如針對女性發病率最高的乳腺癌和卵巢癌,類似遺傳性乳腺癌-卵巢癌綜合症(HBOC),腫瘤遺傳基因主要檢測BRCA1/BRCA2基因,其對腫瘤發病的影響是非常巨大。

在不進行臨床乾預的情況下,攜帶者中大部分女性最終都會身患癌症。

對於這一類基因,歐美國家的研究非常多,資料庫也很豐富,解讀和應用也相對成熟。如哪些變異有影響,哪些變異沒影響,哪些影響大,哪些影響小。攜帶者應如何進行預防和早篩的策略等。

雖然中國國內這一領域剛起步,藉助了國外現有的一些基礎,但已經在建立屬於自己的資料庫。

腫瘤易感基因檢測技術主要是基因測序法和高通量基因測序法(NGS,二代測序/新一代測序)以及基因晶元。以目前的技術水準來說已經很成熟。

腫瘤遺傳基因檢測的核心在於數據解讀。

檢出有什麼變異是不直接產生意義的,變異與疾病的關係才是核心,比如有些變異分析可推測如何影響蛋白功能,但仍需實例驗證。而這些檢測結果,只能通過對大數據進行解讀,變異與疾病的關係越明確、越精確,對受檢者來說就越能發現癌症隱患。

靶向藥物顧名思義是針對特定靶點的藥物。這類藥物的特點是,療效顯著,副作用較小,對人群具有高度選擇性(即特定基因)。通過特定的基因檢測篩選最有可能獲益的人群,即是靶向用藥的伴隨診斷。這種伴隨診斷經常與藥物研發共同開發出來,有充足的臨床數據,技術層面和解讀層面都比較成熟。

3.1 基因變異檢測

在腫瘤中檢測基因方向,最核心的技術要求是靈敏度。在組織樣本中,會有不同比例腫瘤細胞和正常細胞,而在腫瘤細胞中,突變的細胞也是佔據了一定的比例(具體這兩個比例是多少,每個樣本都不一樣),如果技術不夠靈敏,可能就會出現發生了突變而檢測不出來的情況;而在血液樣本中,這種要求就更高,因為使用血液檢測腫瘤基因突變,是通過血液當中的遊離腫瘤DNA(ctDNA)來檢測突變情況,而血液當中絕大部分是正常的基因組DNA(來源於血細胞),ctDNA含量非常不穩定,可能極低。 靈敏度包括兩方面的技術,一是提取和富集的技術,二是檢測的技術。

基因變異方向檢測在中國應用最多的是檢測治療肺癌的EGFR-TKIs基因,其決定是否能使用靶向葯AZD9291奧希替尼。(參考閱讀:《肺癌基因檢測首檢1代靶向葯可以吃,為什麼耐葯後二檢3代靶向葯卻不能用?》)EGFR基因突變檢測的常用技術包括基因測序法、ARMS-PCR法、HRM-PCR法等。目前檢測界主流推薦用是ARMS法,因為很靈敏,特異性好,操作簡單。技術難點,應該是使用血液樣本檢測的技術。

3.2 融合基因檢測

使用克唑替尼、阿來替尼等治療肺癌ALK-TKIs的靶向藥物,必須檢測EML4-ALK融合基因。檢測融合基因的技術難點在於是否能夠準確發現融合狀態(常見融合方式和少見融合方式),以及試劑和操作流程的可靠性、穩定性。 常用的融合基因檢測技術包括熒光原位雜交(FISH)、熒光定量PCR法等。目前主流標準是熒光原位雜交(FISH),因為FISH直接而客觀。但仍然存在操作複雜、通量低等不足之處。熒光定量PCR更加方便,但只能檢出已設計好的融合類型。

3.3 基因擴增|基因拷貝數變異檢測

基因擴增(CNVs)是乳腺癌常用的檢測方向,使用抑製乳腺癌anti-HER2的呱柏西利等靶向葯前需要檢測。HER2基因擴增 CNV檢測的常用技術為熒光原位雜交(FISH)。也有使用免疫組織化學方法進行檢測,但其測定的並非CNV本身,而是與CNV相關的,蛋白的表達情況。 目前CNV的主流標準是FISH。

4.化療藥物療效檢測

化療藥物是殺傷增殖細胞的藥物。這類藥物通常通過作用於特定的信號通路殺傷增殖期的腫瘤細胞,另外其在體內的代謝情況也影響到血葯濃度,從而影響最終的治療效果。這類檢測目前醫學界有充足的臨床數據,技術層面和解讀層面都很成熟。

4.1 基因表達檢測

比如使用鉑類藥物治療前需要檢測ERCC1基因表達。

基因表達檢測的常用技術為熒光定量PCR法。 基因表達檢測的技術難點在於判斷標準。不同於基因突變或基因融合,是一個定性的結論,有或無,判斷基因表達水準的高低,需要一個參考體系,而這一體系在不同的實驗室中是不一樣的,通常來說,檢測樣本的基數越大,參考體系越可靠。

4.2 基因多態性檢測

使用多種化療藥物ABCB1(MDR1)前需檢測基因多態性。

基因多態性檢測的常用技術為基因測序法、ARMS-PCR法等。基因多態性和單鹼基因突變本質沒有什麼不同,都是在基因序列上的單個鹼基發生改變,差別在於基因多態性要麼一半變異,要麼全部變異,因此對檢測的靈敏度沒有什麼要求。

5.基因檢測數據解讀|用藥參考

目前中國國內用於解讀基因檢測的數據,有些來源於臨床數據,有些來源於FDA批準的檢測方案數據。

需要說明的是,人種差異不體現在癌症領域,美國白種人和黑種人的數據參考同樣可以應用於中國人。人種差異主要是體現在流行病學的差異,而同樣的基因變異則會引起同樣的結果,這個是沒有差異。

基因檢測數據解讀,價值主要體現在指導治療和用藥推薦上。

比如A患者通過基因檢測發現有某基因個突變,查詢資料庫已有的病例,發現同樣基因突變的B患者使用某種藥物,療效有顯著差異。

那麼A患者通過使用B患者病例中相應的抑製劑,癌細胞敏感的可能性更高,患者延長生存期和提升生存質量的機會更大。

原文來自百配健康,經作者授權轉載。


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