《世醫得效方》中，灸法治療佔了針灸部分的十分之九。他受《肘後》、《千金》的影響較大，對陰證、陽證、寒證、熱證，多採用灸法。灸治常根據病證和部位而用艾炷灸，艾炷有竹筋大、麥粒大、綠豆大、雀糞大等，並指出「大小以意斟量」。
所灸壯數並不多，多數為7～21壯，僅在俞、募穴和膏肓穴有灸至百壯者。同一穴位灸的壯數也因病而異，例如諸氣灸膏肓百壯，而癆瘵灸膏肓僅9壯；又如反胃灸足三裡7~9壯；而胃中積熱灸足三裡30壯。灸法除艾炷灸外，還有隔鹽灸、隔蒜灸、隔物灸等。灸治有「以柳枝煎湯洗後灸之」，也有灸後「以溫湯浸手帕拭之」等。
危氏施針刺，大多用於實熱證。如喉病，「治頰腫及纏喉風等，又氣急者，實熱針足三裡，虛熱灸足三裡」。又如治瘧疾、腰痛、腳氣等實邪為患，多用針刺或刺絡瀉血法。
他取穴少而精。在56個病症中，用穴計194個，其中經外奇穴(尺、臣覺、天憑、手疰注、疰市、氣端、外陵、神光、天倉、交儀)9個。每個病症僅用1～2個穴。
他取穴按臟腑而分經取之。例如諸氣：凡上氣冷發、臍中雷鳴轉叫、嘔逆不食，灸太沖；心腹諸病堅滿煩痛、憂思結氣心痛、吐下食不消，灸太倉；臍下攪痛、流入陰中、發作無時，此冷氣，灸關元、膏肓；短氣不語，灸大椎、肺俞、臍中；乏氣，灸神道。
另有「針灸傷」一節，用內托黃芪丸治針灸傷經絡膿流不止。由黃芪、當歸、肉桂、木香、乳香、沉香組成，研末糊丸內服。
臨證經驗
危氏對56個病症都載有針灸療法，選錄於下：
(一)頭面疾患
頭痛：灸囟會。
鼻病：灸囟會、通天，左臭灸右，右臭灸左。
口眼?斜：灸耳垂下，左灸右，右灸左。
中風失音：灸天倉(在頸大筋前曲頰下，扶突穴後動應手)、百會。
目痛：灸上星、風池。
目不明：針承泣。
喉病：針風府、少商、合谷、上星；如頰腫及纏喉風等症，實熱針足三裡，虛熱灸足三裡：如根腳咽喉常發者，於耳垂珠下半寸近腮骨灸，或灸足三裡。
瘰癧：灸肘骨尖，左灸右，右灸左，或蒜片貼癧上灸之。
項癭：灸大空穴、肩髃；或灸兩耳後髮際。
(二)胸腹疾患
奔豚：灸氣海、關元、期門；或灸章門；或灸中極。
症瘕：灸太溪、氣海；或灸天樞；或灸中脘。
心痛：灸上脘；或灸中脘；或灸陰都。
嘔吐：灸尺(在肘約上動脈)、乳根；或灸神光(在兩肋旁二寸)，或灸石關。
霍亂：隔鹽灸神闕和灸氣海。
咳逆：灸乳根，男左女右。
反胃：灸乳根、水分、內踝下三指稍斜向前、中脘、足三裡。
咳嗽：灸肺俞或乳根；或灸天突、膏肓俞。
喘急：灸肺俞、天突。
下痢：灸脾俞；或灸陰交、神闕、關元；或灸肓俞。
脹滿：灸脾俞；或灸肝俞；或灸水分；或灸氣海；或灸大腸俞；或灸承滿；或灸三焦俞。
吐血：灸中脘；或灸肺俞；或灸大陵；或灸上星和足大指節橫理三毛。
腸風下血：灸二十椎；或灸命門、腎俞。
乳癰：以灸炷四枚圍著所作處，同時下火，各灸7～1壯；或隔蒜灸其中心。
肺癰：灸肺俞。
(三)腰背四肢疾患
腰痛：針委中出血；或灸命門、腎俞。
臂痛：針肩髃。
腳氣：灸風市；或灸三裡；或灸絕骨、犢鼻、肩髃；或灸曲池和氣湍(足十趾端)。
(四)其他疾患
屍厥：灸百會、氣海、石門。
疝氣：灸足大指次指下中節橫紋當中；或量口角為一邊成等邊三角形，上角於臍中，兩邊是穴，左偏灸右，右偏灸左；或灸風市、氣海、外陵(臍旁一寸半)。
脫肛：灸臍中；或灸橫骨和長強。
諸痔：灸命門；或灸脊中；或灸長強。
痼冷腎虛：灸腎俞；夢遺灸三陰交；虛極灸膏肓、氣海。
心恙(神志病)：灸百會；或灸天憑(在頸大筋前曲頰下扶突後動應手)；或灸天樞；或灸手逆注(在左右手腕後六寸)；或灸中脘；或灸間使；或灸臣覺(在背上夾內側，反手所不及者，骨芒穴上撚之)；或灸上星；或灸合谷；或灸左右脅下對屈肋頭兩處；或灸人中、少商、隱白；或針足大指爪甲下。
癆瘵：灸腰眼；或灸四花；或灸膏肓。
陰脫：灸關元、大敦。
腫滿：灸足第二指上一寸半或兩手大指縫頭；或灸太沖、腎俞。
小兒龜背：灸肺俞、膈俞。
橫生逆產：灸至陰。
產後小便不通：於神闕穴隔鹽和蔥白，用艾炷灸。
崩漏：灸小腹橫紋當臍空直下和三陰交；或灸交儀(在內踝上五寸)。
疔瘡：灸掌後橫紋後五指，男左女右。
針灸單穴治病36絕招
1、穴 名：下都（經外奇穴、八邪穴之一）
取穴方法：手背四、五指縫尖上五分處。
主 治：發燒。
手 法：連續不斷掐按1—2分鐘。
2、穴 名：少海（手少陰心經，合穴）
取穴方法：屈肘，肘橫紋尺側端與肱骨內上髁連線的中點處。
主 治：心動過速。
手 法：揉按1-2分鐘。（60-70/分）
3、穴 名：通裡（手少陰心經、絡穴）
取穴方法：神門穴上一寸。
主 治：心動過緩。
手 法：按揉1—3分鐘，300-500次。
4、穴 名：大陵（手厥陰心包經、原穴）
取穴方法：腕關節掌側第一橫紋正中，兩筋之間，
主 治：失眠症。
手 法：點按1—2分鐘，直按斜上頂。
5、穴 名：神門（手少陰心經、原穴）
取穴方法：掌側腕橫紋尺側上方凹陷處。
主 治：多汗症。
手 法：直按斜頂向內關1—2分鐘。
6、穴 名：湧泉（足少陰腎經、井穴）
取穴方法：足底前、中三分之一交界處，屈足卷趾時呈凹陷處。
主 治：足心熱。
手 法：揉按36次。
7、穴 名：盲俞（沖脈、足少陰之會穴）
取穴方法：肚臍旁開五分。
主 治：頭痛。
手 法：拇、中指按後，斜向上頂，左治右，右治左。
8、穴 名：列缺（手太陰肺經、絡穴、八脈交會穴，通於任脈）
取穴方法：兩手虎口相交叉，食指尖所指筋骨凹陷處。
主 治：頭頂痛。
手 法：直按斜向上頂。
9、穴 名：懸鐘（足少陽膽經、八會穴之髓會）
取穴方法：足外踝尖直上三寸，腓骨後緣。
主 治：偏頭痛。
手 法：按揉3—6分鐘，左治右、右治左。
10、穴 名：定喘（華佗夾脊）
取穴方法：在大椎旁開五分處。
主 治：哮喘。
手 法：斜向肩部頂1-2分鐘。
11、穴 名：止瀉（任脈上，關元、石門中間）
取穴方法：臍下二寸半取之。
主 治：腹瀉。
手 法：直按稍斜上頂。
12、穴 名：降壓（足厥陰肝經上）
取穴方法：在大敦與太沖之間，
主 治：高血壓。
手 法：震顫點按1-2分鐘。
13、穴 名：足三裡（足陽明胃經；合穴、胃下合穴）
取穴方法：外膝眼下三寸，四橫指。
主 治：腹部疾患、高血脂症，止胃痛。
手 法：直按斜向下1-2分鐘。胃痛時，用雙拇指按揉患者雙腿足三裡穴(位於膝蓋下三寸，脛骨外側一橫指處)，待有酸麻脹感後 3一5分鐘，胃痛可明顯減輕。
14、穴 名：大骨空穴（經外奇穴）
取穴方法：拇指近節指骨與遠節指骨連接橫紋橈側面中點赤白交界處。
主 治：白內障。
手 法：用力點刺，重手法效果好。
15、穴 名：神庭（督脈）
取穴方法：前髮際正中直上0.5寸。
主 治：腦疲倦，（醒腦）
手 法：中指點按刺激。
16、穴 名：血海（足太陰脾經）
取穴方法：髕骨內上緣二寸。
主 治：眼皮浮腫。
手 法：拇指強力度按壓。
17、穴 名：肩痛穴（足陽明胃經上）
取穴方法：足三裡下約三寸左右，脛骨邊緣。
主 治：肩周炎。
手 法：強力度按壓1-2分鐘，左治右，右治左。
18、穴 名：扭傷穴（經外奇穴）
取穴方法：曲池（手陽明大腸經）與陽池（手少陽三焦經）聯線的上1/4與下3/4交點處。
主 治：急性腰扭傷。
手 法：強力度，同時按壓兩臂的扭傷穴。
19、穴 名：坐骨穴（新穴）
取穴方法：大轉子與尾骨尖聯線中點下一寸處。
主 治：坐骨神經痛。
手 法：拇指用力直按，斜向下頂。
20、穴 名：足跟點（手針穴位）
取穴方法：大陵穴與勞宮穴聯線上找痛點。
主 治：足跟痛。
手 法：按揉1-2分鐘。
21、穴 名：承漿（任脈）
取穴方法：唇溝之中央凹陷處。
主 治：小兒厭食症。
手 法：中力度按揉3-5分鐘。
22、穴 名：遺尿點（手針穴位）
取穴方法：手小指末節橫紋中點。
主 治：小兒遺尿（腎虛）
手 法：輕按揉1-3分鐘。
23、穴 名：天柱（足太陽膀胱經）
取穴方法：頸部大筋外緣之後髮際五分凹陷處，啞門旁開1.5寸。
主 治：喉頭腫痛。
手 法：輕揉按2-4分鐘。
24、穴 名：太沖（足厥陰肝經，腧穴、原穴）
取穴方法：足背一、二趾縫間上一寸五分處。
主 治：鼻出血。
手 法：垂直用力點按。
25、穴 名：上迎香（經外奇穴）
取穴方法：在眼內眥下五分處。
主 治：鼻竇炎。
手 法：按揉1-2分鐘。
26、穴 名：少澤（手太陽小腸經，井穴）
取穴方法：手小指尺側，距指甲0.1寸。
主 治：急性結膜炎。
手 法：拇指重掐法。
27、穴 名：大抒（足太陽膀胱經）
取穴方法：第一胸椎棘突下旁開一寸五分處。
主 治：麥粒腫。
手 法：直按斜向頸椎用力頂按。
28、穴 名：冠心穴
取穴方法：左足背解溪穴（足太陽膀胱經）至2、3趾骨聯合處聯線中點。
主 治：冠心痛，止痛。
手 法：指端或用原子筆芯按壓5分鐘。
29、穴 名：元駿穴
取穴方法：位於左手手掌心中指指關節下。
主 治：冠心病，心絞痛。
手 法：一指禪推法點揉。
30、穴 名：關元（任脈，小腸募穴）
取穴方法：臍下四橫指，中線。
主 治：失眠。
手 法：半臥後揉100-200下，45℃水泡足，按揉湧泉穴200下。
31、穴 名：四白（足陽明胃經）
取穴方法：目正視，瞳孔直下，當眶下孔凹陷中。
主 治：便秘。
手 法：按揉腹部自右向左推200下；排便時按雙側四白加長強穴（長強尾骨端凹陷處）。
32、穴 名：安眠穴（經外奇穴）
取穴方法：翳風（手少陽三焦經）與風池穴（足少陽膽經）邊線中點。
主 治：失眠、偏頭痛。
手 法：中度點按。
33、穴 名：牽正穴（經外奇穴）
取穴方法：耳垂前5分至1寸。
主 治：面神經麻痹、口腔潰瘍。
手 法：中度向前斜刺，（口腔潰瘍加小腸反射區）。
34、穴 名：失眠穴（經外奇穴，足底）
取穴方法：足底足跟正中點。
主 治：失眠、足跟痛。
手 法：重度力點按。
35、穴 名：閃腰穴（足太陽膀胱經上）
取穴方法：在小腿肚上，承山穴（足太陽膀胱經）與崑崙穴（足太陽膀胱經）連線上三分之一與中三分之一交點附近有一壓痛點。
主 治：腰扭傷又稱閃腰。
手 法：點按。患者俯臥，醫者找出雙側「閃腰穴」後，用雙手拇指猛然點按患者雙側穴位，壓放三至五次後，再平揉一至三分鐘，以患者忍受且微有出汗為度。接著輕柔、和緩地按摩腰部數分鐘結束治療。一次手法完畢後，患者多有明顯好轉，每日或隔日一次，一至四次治療後，腰痛癥狀就會消失。
36、穴 名：落枕穴（經外奇穴）
取穴方法：位於手背側，當第2、第3掌骨間，指掌關節後約0.5寸處。
主 治：落枕。
手 法：落枕穴在手背上。在手背上食指和中指的骨之間，用手指朝手腕方向觸摸，從骨和骨變狹的手指盡頭之處起，大約一指寬的距離上，一壓，有強烈壓痛之處，就是落枕穴。用食指指腹，或原子筆頭（不是筆尖）按在此穴上，稍微用力刺激它，落枕的脖子便會變得輕鬆多了。
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