前沿：發現新型艾滋病毒株

近日，雅培公司和密蘇裡大學的研究人員研究人員鑒定出一種新型的HIV毒株，該毒株是HIV-1群M型的一部分。該研究成果於2019年11月6號發表在期刊Journal of Acquired Immune Deficiency Syndromes上。

人類免疫缺陷病毒（HIV）大流行的起源可追溯到剛果民主共和國（DRC），據估計該病在1920年代出現。與該地區HIV的早期傳播相一致，DRC菌株顯示出廣泛的遺傳多樣性，包括所有公認的亞型，許多循環重組形式（CRF）以及大量獨特的重組形式（URF）和無法分類的序列。

當前的HIV命名準則規定，至少需要三個非傳播相關病例的完整基因組序列，才能為HIV建立新的亞型或CRF分類。兩個無法分類的完整基因組序列83CD003（AF286236）和90CD121E12（AF457101）形成了一個與其他亞型和CRF不同的分支，該分支與相鄰的亞型H和J等距，因此提出了一個建議，即這些序列是新亞型的成員，該提案進一步得到每個基因組與所有其他M組亞型的13.2-14.5％核苷酸差異的支持。這些菌株分別於1983年和1990年在剛果民主共和國收集，在其他地方未發現。由於L型不是正式分類，因此這些分離物通常不包括在用於對HIV序列進行分類的參考序列比對中。

圖A.

HIV-1組M最大似然系統樹（7578 bp）顯示了CG-0018a-01組的序列

研究人員表示這種稱為HIV-1 M類亞型L的新毒株極為罕見，該研究共篩查了全球超過60％的血液樣本，並且要保證篩選“每次都必須正確”，可見其工作強度之大，工作難度也是難以想象的高。

樣本CG-0018a-01於2001年收集在距剛果民主共和國開賽西省卡南加12公里的Good Shepard醫院，根據擴增的亞基因組PCR片段序列，由於低病毒載量（

然而，目前科學家們尚不清楚該種HIV病毒的新變種會以什麽樣的形式進入傳播媒介，以及目前的一些相應治療艾滋病的手段是否對其有效，都還是個未解之謎。這一發現提醒我們，要結束艾滋病毒大流行，必須繼續持續關注HIV病毒株的變化，並利用技術和資源的最新進展來監測其演變。

編輯：蘇複

來源：BioWorld

文獻鏈接：

https://journals.lww.com/jaids/Abstract/publishahead/Complete_genome_sequence_of_CG_0018a_01.96307.aspx