腸道微生物系統是人體最大最複雜的微生態系統，其中存在400?500種不同 類型的細菌，其數量約10倍於人體細胞，重量約 為1~2kg，對人體健康有著巨大的作用。
腸道細菌分為有益菌和有害菌。有害菌能通過代謝產生酚、吲哚、亞硝酸、亞硝胺和偶氮化合物等有毒物質，加速人體衰老和誘發癌症發生； 有益菌則可抑製有害菌的繁殖，清除其毒素，減少內毒素；同時可分泌大量的活性物質，促進新 陳代謝和免疫功能；人體腸道內益生菌的比例越高，微生態環境就越好，腸道就越顯年輕有活力。
具體說來，腸道益生菌對人體的作用有以下幾方面：
1.維持微生態平衡和腸道健康。益生菌是腸道清道夫，使腸道菌的構成發生有益變化，促進體內消化酶的分泌和腸道蠕動，清除 腸道垃圾，抑製腐敗菌的繁殖。益生菌中的凝結芽孢桿菌能促進腸道蠕動，防治便秘，避免體內毒素堆積，防止細胞老化，對小兒腹瀉、成人潰瘍性腸炎、細菌性腸炎有顯著防治效果，並可使肌膚更加白皙健美。
2.產生特殊酶系。益生菌可利用本身所特有的某些酶類補充宿主在消化酶上的不足，幫助分解上消化道未被充分水解吸收的營養物質，有利於宿主進一步吸收利用，增加人體必需的維生素、 氨基酸、無機鹽類（如鈣、磷、鐵、鈷等）的吸收和利用。同時，減少毒素與腸道黏膜受體的結合，促進機體健康。
3.增加免疫功能抗腫瘤。凝結芽孢桿菌等益生菌對使人致癌的腸中亞硝胺有98%的高吸收率，可減少腸癌的發生。乳酸菌菌體抗原及代謝物還通過刺激腸黏膜淋巴結，激發免疫活性細胞，產生異性抗體和 致敏淋巴細胞，調節機體的免疫應答，防止病原菌侵入和繁殖，為致病細菌的侵入和繁殖設定一道屏障。
4.提高營養利用率。益生菌能將食物中的大分子蛋白質部分 降解為小分子肽和遊離氨基酸，利於胃腸消化吸收。乳酸菌可分解乳糖成為葡萄糖和半乳糖，進而進一步分解為小分子化合物，有助於兒童腦及神經系統的發育。益生菌在代謝過程中消耗部分維生素，有利於增加腸內維生素的穩定性。益生菌產生有機酸，使鈣、磷、鐵等元素處於易吸收的離子狀態，提高利用率。
5.降低膽固醇。益生菌菌體成分或代謝產物有抗膽固醇因子，能顯著減少腸道對膽固醇的吸收。同時，乳酸菌可以吸收部分膽固醇並將其轉變為膽酸鹽排出體外。
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