益生菌是一類對宿主有益的活性微生物，是定植於人體腸道、生殖系統內，能產生確切健康功效從而改善宿主微生態平衡、發揮有益作用的活性有益微生物的總稱。
哪些菌種可以用於食品？
我國在2001年發布了《可用於保健食品的益生菌菌種名單》以及《可用於保健食品的真菌菌種名單》，名單包括兩歧雙歧桿菌（Bifidobacterium bifidum）、嬰兒雙歧桿菌（Bifidobacterium infantis）等10個菌種。
我國還先後於2010年和2011年發布《可用於食品的菌種名單》和《可用於嬰幼兒食品的菌種名單》，並在隨後幾年以公告形式對名單進行了增補。
截止2019年，可用於食品的菌種名單中包括了35個種或亞種，可用於嬰幼兒食品的菌種包含：
嗜酸乳桿菌
（Lactobacillus acidophilus）NCFM
動物雙歧桿菌
（Bifidobacterium animalis）Bb-12
乳雙歧桿菌
（Bifidobacterium lactis）HN019
等9個菌株。
不在名單中、且在我國沒有傳統安全食用歷史的微生物菌種，應按照相應的管理規定，申報獲得批準後才可用於食品。
目前，批準詳單將儘快整理髮布。
是否所有可食用的微生物都是益生菌？
當然，並非所有的可食用微生物都可稱之為益生菌。我國益生菌常用於食品、膳食補充劑，和活菌藥物及微生態活菌製劑。
近年來，隨著「益生菌」這一概念的廣泛應用，市面上存在將「益生菌」的概念作為廣告噱頭濫用的情況。
中國營養學會益生菌益生元與健康分會於2019年5月29日發布的《益生菌與健康專家共識》對益生菌的定義是：
益生菌是活的微生物，當攝入充足的數量時，對宿主產生健康益處。
發酵食品中的微生物不能直接稱為益生菌，腸道中的有益菌、糞菌移植物及相關製品也不屬於當前益生菌概念。
只有在進行分離鑒定、安全評價及功能試驗後且符合益生菌概念的，才能稱為益生菌。
益生菌有哪些特性？
1
益生菌必須是活的
2
益生菌必須是安全的
3
益生菌的作用與其劑量有關
4
必須有足夠證據證明益生菌對人體是有益的
5
益生菌的作用具有菌株特異性
益生菌法規發展趨勢
我國2001年發布的《益生菌類保健食品申報與審評規定（試行）》（國食葯監注[2005]202號）規定：「益生菌類保健食品系指能夠促進腸內菌群生態平衡，對人體起有益作用的微生態製劑」。
目前，現行的益生菌食品管理規定及相關技術規範已實施較長時間，部分規定和要求已無法適應益生菌研究的最新進展，也不能滿足益生菌產業的發展要求。
如死菌及菌種代謝產物可以作為益生菌類保健食品的類別、標籤標識未要求標示菌株號等。
因此，我國尚需結合國際上的經驗，儘快完善相應的管理規定和技術規範，進一步細化菌種標準標識的相關規定，及時更新和完善益生菌類保健食品功效評價的相關技術規範，引導企業和科研機構合理開發和應用。
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