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B肝DNA病毒如何改變3D基因組?法國研究人員提供,靶向藥新見解_細胞核_整合_cccDNA

在細胞核內轉錄其DNA的病毒,必須適應控制轉錄調控的現有細胞機制。最近的技術有所突破,並突出了細胞基因組的高度分層組織及其在基因表達調控中的作用。

來自Viruses:法國巴斯德研究所等研究人員發表題為B肝病毒與3D基因組結構之間的串擾

B肝DNA病毒如何改變3D基因組?法國研究人員提供,靶向藥新見解

在科學雜誌《Viruses》上,研究人員提供了有關B肝病毒如何與 3D基因組相互作用及其對病毒和細胞基因表達影響的最新知識,還探索了其他DNA病毒藥物開發策略。

結果表明,HBV整合屬於早期感染常見事件。整合的HBV基因組無法複製,但被認為以多種方式促進HCC發展。已在大多數HBV相關HCC(70-90% 的 HCC)中發現了整合的HBV序列,並且通常是克隆或寡克隆的。這些整合的序列,可能負責插入誘變和或基因組重排。然而,只有少數研究旨在正確破譯導致HBV整合後細胞基因失調的機制。

來自科學雜誌《Viruses》:圖 2. HBV與3D基因組相互作用的圖形總結

在本研究中,研究人員發現HBV與其他病毒一樣,利用 3D基因組組織進行自身轉錄。然而,需要進一步的研究來了解病毒是如何在這些染色體位點非隨機定位,以及這些空間定位的破壞是否會導致其沉默甚至消除。此外,HBV不僅利用基因組折疊進行自身轉錄,而且研究人員還觀察到病毒DNA接觸至少受HBV感染的原代人類肝細胞中,會干擾細胞基因的表達。

雖然,以上發現需要在體內才能夠得到進一步證實,但它可能有助於細胞轉化。研究人員還觀察到轉錄沉默的病毒,例如HBV X-,仍然與細胞染色質建立聯繫。儘管HBV接觸的區域,在兩項研究之間有所不同,這可能是由於每個細胞的cccDNA分子數量可能會改變HBV/宿主DNA接觸的分布,但在評估轉錄沉默的cccDNA是否會影響細胞仍然很重要,並通過DNA/DNA接觸的基因表達和表觀遺傳調控。

因此,本研究人員認為,如果沉默的cccDNA分子仍然與宿主染色質建立聯繫,那麽旨在沉默HBV cccDNA的慢性攜帶者的治療方法可能無法消除HCC發生的全部風險,這可能導致與癌症發展相關的基因失調。

最後,由於病毒DNA整合發生在基因表達和基因組 3D組織緊密聯繫並相互影響的背景下,因此,在 3D基因組組織的背景下探索HBV誘導的HCC。對癌症中3D基因組破壞的研究正在取得進展,研究DNA病毒是如何改變 3D基因組組織將有助於更好地了解 3D結構失調如何促進腫瘤發生。破譯HBV整合後肝細胞轉化的分子機制,可能為合理開發靶向藥物帶來有用的見解。

小番健康結語:我們簡單梳理一下研究人員觀點。研究人員深入探索了HBV怎樣和細胞 3D基因組相互作用,結果發現,感染野生型病毒 (HBVwt) 的細胞中的 HBV cccDNA 優先與活性染色質和區室 A 基因組區域相關;HBV 缺乏轉錄調節因子 HBx (HBV x-) 的表達,被轉錄抑製並與 SMC5/6 複合物相關,並優先與異染色質和區室 B 基因組區域相互作用。

HBV接觸反過來會干擾細胞基因調控,並可能導致宿主基因的上調或下調。本研究由法國蒙彼利埃大學人類遺傳學研究所、法國巴斯德研究所研究人員發表在科學雜誌《Viruses》上。返回搜狐,查看更多

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