1911年10月10日，武昌起義驟然爆發，湖廣總督瑞澂連夜緊急求援，慶親王奕劻奉命召集滿清貴胄毓朗等人商討應對之策。三天后，清政府派遣蔭昌督師南下，水陸兩軍並進鎮壓。然而，蔭昌督率北洋軍不力，在前線遷延貽誤使清廷失去了用武力來解決危機的最佳時機。滿洲貴胄束手無策，清廷被迫迅速起用袁世凱。10月14日，清廷任命袁世凱為湖廣總督，並賦予指揮武漢前線軍事全權。
10月19日，袁世凱向清內閣致電，令馮國璋速赴彰德以面授軍機要事。23日，馮國璋抵達彰德，與袁世凱籌商前線軍事部署。緊接著，袁世凱擬定了應對時局的辦法，令馮國璋為第一軍總統，迅即趕往武漢前線，妥善統籌軍務，先穩住前線局勢；致電清廷要求組建第二軍，令段祺瑞為總統官，迅速增援武漢前線，與第一軍武漢前線會合，用優勢兵力反攻，以扭轉戰局。
按照袁世凱的戰事安排，馮國璋在彰德奔赴武漢前線，與蔭昌接手後就任第一軍總統，並繼續指揮對漢口的戰鬥。在馮國璋的嚴厲督促下，清軍憑借火炮及機關槍的武器優勢，兼以火攻，對民軍構成巨大殺傷力，並佔領漢口。緊接著馮國璋繼續督率清軍發起攻堅戰，從此，漢陽、漢口及長江北岸，均被清軍佔領，民軍不得不退到長江南岸，對武昌形成巨大的軍事壓力。
隨後馮國璋多次要求乘勢攻打武昌，但與袁世凱謀取和談的宗旨相悖。對於袁世凱開辟的和局，馮國璋多有不滿，又無法阻止，只得向清廷請纓獨自領兵再戰民軍。袁世凱於12月1日命令馮國璋停止清軍渡江進攻武昌 。
袁世凱對馮國璋的自我主張頗為憂慮，派遣心腹勸說馮國璋；“革命黨一旦反攻過來，你打算怎麽辦？”馮說；“我只有盡忠報國，不知有他。”袁世凱第二次又派人勸說馮國璋；“天下紛擾，你不要固執己見，倘時機到來，你也可酌情行事。”馮說；“我意已執，請勿多言。”面對各種勸說，馮國璋不為所動。此時的馮國璋隻專注於軍事領域，缺乏政治眼光，求戰心切，成為袁世凱推進南北談判的障礙。為此，袁世凱不得不將馮國璋調回北京統領禁衛軍，而以段祺瑞接統第一軍。
馮國璋是在袁世凱的提攜和重用下步步高升，成為清廷賴以倚重的軍事將領。他為何要反對袁世凱主導的南北議和？
首先是馮國璋濃厚的忠君觀念不利於審視大局。作為軍事將領，馮國璋隻注重於軍事解決問題，而缺乏明察政局變幻的眼光。豈知軍事是政治的延續，軍事鬥爭需要周全的準備。從當時武漢前線的形勢看，清軍確實佔據軍事優勢，但是也缺乏軍餉及後續增援。馮國璋簡單地認為用武力就可以解決時局，卻沒有體察到在辛亥政局中各種政治力量的角力。馮國璋的積極主戰，是受自身的忠君觀念所驅使。他曾經擔任過貴胄學堂總辦，與滿洲貴胄集團的關係較為和睦，又因軍功被清廷授予二等男爵，更強化了這一忠君觀念。
其次是強烈的功利意識使然。馮國璋立功心切，欲成就蓋世之勳，正欲畢其功於一役之際，卻為袁世凱所阻，也會使他心有不甘。馮國璋相繼佔領漢口、漢陽，急欲攻佔武昌，儼然勝券在握。馮國璋想建立不世之功，表現出強烈的功利意識，而對袁世凱的謀和策略缺乏深思熟慮。馮國璋進攻武昌的要求，屢次被袁世凱所攔最終被段祺瑞替換。
最後是馮國璋認為自己為袁世凱所驅使反被欺騙，亦有憤懣之意。袁世凱秘密開展南北和談是背著馮國璋進行的。回京後的馮國璋獲悉內幕，感慨“吾為豎子所紿，大事去矣!”袁世凱對馮國璋確有意隱瞞與防範，而馮國璋也感受到自己受到欺騙。
回北京後的馮國璋在政治態度上沒有變化，仍是一意主戰，反對共和。1912年1月19日，清廷召開禦前會議，隆裕太后召集王公大臣商定國體，載灃、奕劻、溥倫等支持共和，而溥偉、載澤及載濤等人則堅決反對。針對滿洲貴胄反對共和的態度，袁世凱策動北洋軍人對清廷施壓。隆裕太后在1月30日的禦前會議上決定遜位。這對具有忠君思想的馮國璋更是重要一擊。
馮國璋聽到清帝要遜位消息後，感歎的說；‘唉！皇族甘願退讓，我們今兒還給誰打。這樣看來，大清國的江山就算完啦!’”
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