醫學期刊種類繁多，根據近年湯森路透公布的數據可以看出，SCI雜誌目前數量多達8411本，包括了生命科學和醫學方面的各個方面。所以說選擇一本恰當的期刊是一件十分困難的事情，但是這又是我們在論文發表過程中一個重要而不可避免的環節。
選擇期刊應考慮的因素：
論文主題是否在刊物徵稿範圍內?
論文格式是否符合刊物要求?
論文是否符合刊物的一貫口味?
關於期刊的聲望問題:期刊學術水準高其聲望就高;反之聲望則低。生物醫學工作者都希望科研成果發表在有聲望的高品質生物醫學期刊上。選擇期刊的方法:如果論文主題在一個很窄的分支學科內，那麼選擇範圍只能限制在幾種刊物;如果論文資訊交叉了幾個研究領域，則可有許多種選擇。無論是哪種情況，先列出一個簡單擬選期刊表，然後逐一對進行比較篩選,做出最後抉擇。
筆者在投稿過程中，經常會發現臨床醫生想發表病例報告的情況，但不知道如何選擇合適的期刊。誠然，現在很多醫生在臨床實踐中會發現些罕見病例，分析其臨床資料並結合相關文獻會出病例報告，然後投稿到某雜誌。需要明確的是，很多雜誌現在不傾向於接受，或者根本就不接受病例報告，在這種情況下，投出去的稿件必然會被退回。很多論文甚至在進行同行評審前就被完全退稿處理，其原因是論文不適合期刊的讀者群或不符合期刊的目標和範圍。所以我們投稿之前，一定要花費時間閱讀期刊的收錄範圍(aims & scope),甚至可以下載歷年發表的一些文獻進行研究，以此觀察各個雜誌的偏好。
在如今科學研究競爭如此激烈、文章層出不窮的情況下，一個研究成果如果短時間內不能發表，那時間越長就越難發表，萬一遇上研究成果被同行搶先發表，那真是萬分遺憾的事情了。
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