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新年充電,從一場組學培訓開始

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蛋白質組學、代謝組學已經成為各國研究的重點方向,成為生命科學、臨床科學研究的前沿。為進一步幫助廣大科研工作者快速提升蛋白質鑒定定量、功能注釋、代謝通路分析、後期數據處理與統計學分析、跨組學整合分析等技能,華大學院特推出「蛋白質代謝組學數據分析挖掘補習班」,通過理論授課與實踐相結合的方式,使學員得到全面系統的培訓。

本次講師團隊由華大集團聯合創始人劉斯奇教授及其所在團隊成員擔綱授課。講師長期從事蛋白質組學、代謝組學數據挖掘分析,在組學領域積累非常豐富的項目經驗。

主辦部門:深圳市華大基因學院

舉辦地點:中國 深圳

培訓時間:2019年3月25-28日

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培訓目標

使學員了解最前沿的研究思路並掌握主流的組學研究技術

使學員掌握常用蛋白質組鑒定、質控方法和資料庫的使用

使學員掌握蛋白質功能、網路分析方法、下遊分析之蛋白質功能注釋方法

使學員了解蛋白組-轉錄組-代謝組跨組學挖掘分析

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培訓優勢

一流的講師- 豐富的科研經驗、重大項目執行經驗

全面的課程- 技術原理、分析流程&技術應用相互結合

全新的方法 - 使用開源的軟體&分析流程,更方便、快捷

面對面解決問題 - 與資訊分析、數據挖掘達人面對面探討項目中的瓶頸問題

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培訓課程

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【注】深圳市華大基因學院保留對以上課程資訊(包括主題、課程安排和其他細節等)進行調整的權利,具體課程資訊以實際上課為準。

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培訓對象

從事生命科學、醫學、農學等領域的科研工作者和高校師生

迫切希望提升多組學資訊分析能力的學員

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講師團隊

劉 斯 奇

華大集團聯合創始人、蛋白質組學首席科學家、國務院特殊津貼專家

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早年先後於德克薩斯大學、貝勒醫學院、路易斯維爾大學學習和工作,1999回國參與創建華大基因,長期從事基因表達調控及基因產物、結構與功能研究,從事以質譜技術為核心的腫瘤微環境蛋白質組、微量蛋白質組、非數據依賴採集定量蛋白質組、修飾蛋白質組與代謝組學技術研究與應用開發。

作為首席科學家曾主持並完成了國家科技部973項目 「蛋白質組海量質譜數據的解析及其在人類基因組注釋中的應用」, 863項目「肺癌血清生物標記物的篩選及其應用」等國家級項目二十餘項。

帶領蛋白團隊在國際高水準期刊發表《Quantitative Analysis of the Human AKR Family Members in Cancer Cell Lines Using the mTRAQ/MRM Approach》 、《Quantitative proteomics reveals the temperature-dependent proteins encoded by a series of cluster genes in Thermoanaerobacter tengcongensis》等文章90多篇。

獲得《醯基載體蛋白Ⅲ抗原表位、抗醯基載體蛋白Ⅲ抗體及其用途》、 《非典型性肺炎病毒特異蛋白質和臨床檢測的方法及試劑盒》等授權專利20餘項。

以下展示部分發表文章:

1. Chen X, Zhu Y, Wang Z, Zhu H, Pan Q, Su S, Dong Y, Li L, Zhang H, Wu L, Lou X, Liu S.mTORC1 alters the expression of glycolytic genes by regulating KPNA2 abundances.J Proteomics. 2016 Mar 16;136: 13-24.

2. Kong N, Zhou Y, Xu S, Deng Y, Fan Y, Zhang Y, Ren Z, Lin L, Ren Y, Wang Q, Zi J, Wen B, Liu S. Assessing Transcription Regulatory Elements To Evaluate the Expression Status of Missing Protein Genes on Chromosomes 11 and 19. J Proteome Res. 2015 Dec 4;14(12):4967-75.

3. Fan Y, Zhang Y, Xu S, Kong N, Zhou Y, Ren Z, Deng Y, Lin L, Ren Y, Wang Q, Zi J, Wen B, Liu S. Insights from ENCODE on Missing Proteins: Why β-Defensin Expression Is Scarcely Detected. J Proteome Res. 2015 Sep 4;14(9):3635-44.

戚 達

華大蛋白質方向資深課程顧問、蛋白質組學研究專家

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2008年獲得威爾士大學電腦科學博士學位。2011年在英國利物浦大學開始從事蛋白質組學資訊分析研究,主要參與歐盟第七框架計劃資助的ProteomeXchange項目,作為HUPO-PSI工作組的成員,制定蛋白質組學標準數據格式,包括定量蛋白質組標準mzQuantML,代謝組標準mzTab等格式的制定,開發與Pride資料庫相關的軟體。

2016年負責英國生物技術和生物科學研究理事會(BBSRC)牛頓基金資助的英國-中國-泰國-菲律賓-越南可持續水稻計劃項目,開發生物資訊分析流程,利用蛋白基因組學方法,提高水稻基因注釋的可靠性以及發現新的未知基因。

2017年加入華大基因,擔任蛋白質生物資訊平台負責人。主攻基於質譜的蛋白質組學,代謝組學數據標準化建設,大數據深度挖掘,智能生物資訊分析系統開發。截至當前,在國際著名學術期刊發表文章10餘篇,開發商業化軟體ProteoLabels的原型。具有豐富的生物資訊分析經驗和項目經驗,教學舉一反三。

以下展示部分發表文章:

1. Z. Ren, D. Qi, N. Pugh, K. Li, B. Wen, R. Zhou, S. Xu, S. Liu, A. R. Jones, Improvements to the rice genome annotation through large-scale analysis of RNA-Seq and proteomics datasets, Molecular and Cellular Proteomics, November 2018, mcp.RA118.000832; https://doi.org/10.1074/mcp.RA118.000832

2. D. Qi, C. Lawless, J. Teleman, F. Levander, S. W. Holman, S. Hubbard, A. R. Jones, The representation of selected-reaction monitoring data in the mzQuantML data standard, Proteomics, 2015, 15(15): 2592-96. doi:10.1002/pmic.201400281.

3. D. Qi, R. Krishna, A. R. Jones. The jmzQuantML programming interface and validator for the mzQuantML data standard, Proteomics, 2014, 14(6): 685-8. doi:10.1002/pmic.201300281.

何 燕 斌

華大資深蛋白質組學資訊分析專家

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主要研究方向為蛋白質組學鑒定、定量資訊分析、多肽組學資訊分析及其巨集蛋白質組學資訊分析。先後參與多屆人類染色體蛋白組計劃(C-HPP)資訊分析工作,參與多款華大蛋白分析流程開發。

以下展示部分發表文章:

1. Siqi Li#, Yanbin He# et al. Digging More Missing Proteins Using an Enrichment Approach with ProteoMiner. Journal of Proteome Research 2017 16 (12), 4330-4339.

2. Yan Ren, Yanbin He et.al. Reagents for Isobaric Labeling Peptides in Quantitative Proteomics. Analytical Chemistry 2018 90 (21), 12366-12371.

3. X.U Hong-Kai#, YAN Ke-Qiang#, HE Yan-Bin et al. The Strategies and Challenges in Metaproteomics Bioinformatics[J]. Progress in Biochemistry and Biophysics, 2018, 45(1): 23-35.

專利:

1. Yan Ren, Yanbin He et al. A method and system for protein identification. Chinese national patent (2017, accepted).

2. Shao Weilan, Yanbin He et al. An cold shock expression T-Vector and its application. Chinese national patent (2014, CN 201410501807 A).

趙 容 麗

華大資深蛋白質組學資訊分析工程師

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具有豐富的蛋白質組項目分析經驗,先後參與開發及完善多款華大蛋白質組學分析產品流程。主要研究方向為蛋白質組學鑒定、定量資訊分析、靶向蛋白質組學資訊分析等。

以下展示部分發表文章:

1. Yong-Liang Jiang, Hua Jin, Hong-Bo Yang, Rong-Li Zhao, Shiliang Wang,Yuxing Chen and Cong-Zhao Zhou.Defining the enzymatic pathway for polymorphic O-glycosylation of the pneumococcal serine-rich repeat protein PsrP. J. Biol. Chem. 2017, 292: 6213.

軟體著作權:

MRMpipline, 登記號:2016SR184922

PTPL,登記號:2018SR323854

Acety1MSSPL,登記號:2018SR323536

ModQuantPL,登記號:2018SR323554

GlycoMSPL,登記號:2018SR323557

UbMSPL,登記號:2018SR322797

PhosMSPL,登記號:2018SR322784

PhosphoPRM,登記號: 2018SR540307

DiaPL,登記號:2018SR775736

劉 傑

華大資深蛋白質組資訊分析工程師

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主要研究方向為常規蛋白組學、多肽組學、磷酸化蛋白組學技術研究及其相關資訊分析。

以下展示部分發表文章:

1. Ning Luan, Wang Shen, Jie Liu, Bo Wen, Zhilong Lin, Shilong Yang, Ren Lai, Siqi Liu, Mingqiang Rong. A Combinational Strategy upon RNA Sequencing and Peptidomics Unravels a Set of Novel Toxin Peptides in Scorpion Mesobuthus martensii. Toxins . 2016, 8(10).

2. Bing Xie, Xiaofeng Li, Zhilong Lin, Zhiqiang Ruan, Min Wang, Jie Liu, Ting Tong, Jia Li, Yu Huang, Bo Wen, Ying Sun, Qiong Shi. Prediction of Toxin Genes from Chinese Yellow Catfish Based on Transcriptomic and Proteomic Sequencing. Int. J. Mol. Sci. 2016, 7(4)

3. Mingqiang Rong, Shilong Yang, Bo Wen, Guoxiang Mo, Di Kang, Jie Liu, Zhilong Lin, Wenbin Jiang, Bowen Li, Chaoqin Du, Shuanjuan Yang, Hui Jiang, Qiang Feng, Xun Xu, Jun Wang, Ren Lai. Peptidomics combined with cDNA library unravel the diversity of centipede venom. J Proteomics. 2015, 114:28-37.

梅 佔 龍

華大資深代謝組學資訊分析工程師

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主要研究方向為代謝組學技術研究及生物資訊分析,參與開發多款華大代謝分析流程。

以下展示部分發表文章:

1. Bo Wen, Zhanlong Mei, Chunwei Zeng and Siqi Liu. metaX: a flexible and comprehensive software for processing metabolomics data. BMC Bioinformatics.2017.18:183

2. 劉彥伯,梅佔龍,郭珍玉,曾春薇,欒合密,聞博,劉斯奇.基於質譜信號的代謝物鑒定:生物資訊學的機遇與挑戰[J].生命的化學,2017,(01):49-56.

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收費標準

註冊費

優惠政策

華大生物資訊學補習班老學員或華大長期業務合作夥伴,可享受9.5折優惠;即:5320元/人;

4+1團體優惠,即同一部門有4人同時報名參加該期補習班,可額外贈送1個名額;即:4480元/人;(只限於同一期補習班)

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報名方式

【線上報名】

提交並支付,即可報名成功。

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常見問題解答

如何支付培訓費?

答:可通過在線支付 銀行匯款 網上轉帳等方式支付培訓費。

本期培訓課程是否可以使用我自己的筆電電腦?需要什麼配置?

答:要求Windows 7、8、10,CPU 2G以上,記憶體4G以上,同時電腦需要連接有線網路埠。

聯 系 我 們

聯繫人:桂老師 13168778067

鄭老師 13424398069

時間:工作日 9:00-12:00 14:00-18:00

郵箱: [email protected]

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