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etDNA可作為基因突變檢測的優質標本來源指導肺癌治療決策

整理:腫瘤資訊小編

在第18屆世界肺癌大會的「MA 20: 肺科/內窺鏡檢查最新進展」專場,復旦大學附屬中山醫院呼吸科暨上海市呼吸病研究所童琳博士報告了一項研究(MA 20.13: etDNA: Tumor-Derived DNA from Pleural Effusion Supernatant as a Promising Source for NGS Based Mutation Profiling in Lung Cancer),憑藉這項研究摘要,她榮獲了2017 WCLC的Travel Award。以下為研究主要內容。

童琳教授:非常感謝腫瘤資訊的採訪,我是來自復旦大學附屬中山醫院呼吸科的童琳,也是上海呼吸病研究所的一員。很榮幸在今年的世界肺癌大會上有一項口頭報告,這項研究採用胸水的上清DNA檢測腫瘤的驅動基因。在當今的肺癌治療中,靶向治療依然佔據非常重要的位置。針對靶向治療必須有相應的基因檢測結果,但在臨床上有相當一部分患者無法取得腫瘤組織標本,於是就引入了液體活檢。但血液標本的液體活檢有一定缺陷,它需要依賴腫瘤釋放DNA到血中,敏感度、特異性都存在一部分問題。我們所彙報的這項研究採用惡性胸腔積液患者的胸水DNA檢測。

研究納入了63位合併惡性胸腔積液的肺癌患者,其中30例與組織活檢標本進行對照。我們對這部分患者的胸水進行離析,從上清標本中提取腫瘤來源DNA(etDNA),從胸水的沉渣細胞中提取腫瘤來源DNA(etc DNA),同時我們進行了組織和血液的基因檢測(採用416個Panel的二代測序)。研究結果顯示,在腫瘤特異性突變的檢出方面,etDNA具有絕對的優勢,跟組織相比它的敏感性最高。比胸水的沉渣和血漿標本的敏感性都要高。在驅動基因的檢出方面,etDNA同樣也很有優勢,我們一共在63例患者中檢出了71個驅動基因,僅有3例胸水上清標本未檢出驅動基因。同時我們對這部分患者進行了隨訪,發現胸水上清的etDNA中檢出的驅動基因,跟治療的療效密切相關。最後我們將這部分患者進行分組,分為胸腔內轉移組和胸腔外轉移組,並進一步分析它的腫瘤相關突變的檢出率,發現對於胸腔內轉移的患者其腫瘤相關突變的檢出率的敏感性更高,而胸腔外轉移的患者的血標本,胸水沉渣標本和胸水上清檢出率相差不大。所以,在M1a期患者中,胸水上清是更優的檢測標本。

研究最終的結論是:etDNA具有更高的腫瘤特異性突變檢出率,是一個未來用於合併胸腔積液患者作為基因檢測的一個優良標本來源,可以解決很多患者沒有組織標本進行基因檢測的問題。

責任編輯:腫瘤資訊-宋小編


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