每日最新頭條.有趣資訊

對致死性轉移性乳腺癌進行全面的基因突變和免疫譜分析

編譯:腫瘤資訊編輯部來源:腫瘤資訊

美國臨床腫瘤學會(ASCO)成立於1964年,是世界上規模最大,學術水準最高,最具權威的臨床腫瘤學會議。2018年ASCO年會即將於6月1日至5日在芝加哥舉辦。今年的主題為「Delivering Discoveries: Expanding the Reach of Precision Medicine」。在本次ASCO年會上將迎來多項腫瘤領域的重磅研究,腫瘤資訊帶您先睹為快。

背景

轉移性乳腺癌(MBC)是一類異質性大大疾病,對這類疾病的耐葯機制和免疫逃逸相關機制對了解甚少。本研究對致死性MBC患者進行了全面對分子檢測,包括原發灶和轉移灶及其腫瘤免疫微環境(TME),T細胞受體表位。

方法

檢測標本包括不同部位的轉移病灶(182個轉移灶,涉及22個轉移器官,每個患者5-36個轉移病灶),原發灶(6個),外周血ctDNA(來自10例患者,其中

5例為ER+/HER2-, 3例為ER+/HER2+, 1例為ER-/HER2+, 1例為ER-/HER2-)。分子檢測的方法包括外顯子測序(86個標本),全外顯子測序 (168個標本), RNA 測序(61個標本),超深度靶向測序(243個標本),靶向測序 (70個標本)和免疫組化IHC檢測 (102個標本)。對測序數據進行最先進的生物資訊學分析。

結果

不同患者之間的腫瘤突變譜存在廣泛差異(共檢測到11,579個變異,中位變異數255.41 mut/患者),此外,同一患者不同轉移病灶之間的變異也存在廣泛差異 (中位變異數122 mut/轉移灶);本研究檢測到突變負荷大於TCGA資料庫的突變負荷(中位數63.5 mut/原發灶,p = 4.927e-14)。根據突變譜的分布和預測新抗原將其分為樹榦突變 (每個患者的所有轉移灶均出現)或分枝突變(僅見於部分轉移灶),而非特有突變(僅見於患者的1個轉移灶)。靶向測序的數據確認了所有患者(n=10)的腫瘤原發灶均含有樹榦突變,而ctDNA據轉移器官而異。10例患者中,9例患者不同轉移器官之間的拷貝數變異相似,除了1例ER+/HER2- 的患者,其轉移灶攜帶1個共同的主克隆(1q 擴增/16q缺失),因此早期就出現亞克隆的進化。根據轉移病灶是否攜帶相同的樹榦突變,分為不同系統進化的分枝突變,雖然不同病灶在進化過程中會出現既往未知的新突變。轉移病灶攜帶有樹榦突變,然後不斷進化出現新的分枝突變,稱之為亞克隆。一個特定亞克隆要麼擁有相同的免疫TME,要麼1個器官上不同的轉移病灶之間擁有不同的免疫TME。每個患者的TCR表位也攜帶有主克隆和亞克隆。TCR表位揭示了轉移病灶的基因與適應性免疫反應共進化。

結論

本研究通過對致死性MBC患者的基因和免疫譜進行全面分析,顯示出基因變異、TME特徵和T細胞適應性免疫反應的異質性。

參考文獻

http://abstracts.asco.org/214/CatView_214_S.html

責任編輯:腫瘤資訊-賈老師版權聲明版權屬腫瘤資訊所有。歡迎個人轉發分享,其他任何媒體、網站如需轉載或引用本網版權所有內容,須獲得授權,且在醒目位置處註明「轉自:良醫匯-腫瘤醫生APP」。

獲得更多的PTT最新消息
按讚加入粉絲團