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新型冠狀病毒與SARS病毒屬於同一個“種”,但不是同一個“簇”

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科技日報記者 張佳星

2月9日,中國工程院院士、華中農業大學教授陳煥春表示,新型冠狀病毒使用與SARS冠狀病毒相同的細胞進入受體,與蝙蝠中發現的SARS相關病毒擁有87.1%的相似形,與SARS病毒有79.5%的相似度。與一個雲南的蝙蝠樣本中發現的冠狀病毒的相似度高達96%。分析發現,新型冠狀病毒屬於SARS冠狀病毒。

同日,中國疾控中心病毒所所長許文波表示:不認為新型冠狀病毒與SARS病毒是同一個病毒。

隨後,陳煥春接受新華社記者採訪時說,新型冠狀病毒不是SARS冠狀病毒,此前在湖北新冠肺炎疫情防控工作例行新聞發布會上的表述存在口誤。

新型冠狀病毒和SARS病毒究竟是什麽關係?科技日報記者獨家採訪病毒學專家、美國加州大學聖迭戈分校醫學院教授Robert Naviaux。

有圖有真相。根據Genebank數據柯瑞給出的冠狀病毒的基因序列,Robert教授利用通用分析軟體phyloT計算出不同病毒間的基因關係圖。

如圖,紅色箭頭所示是2019新型冠狀病毒根據與其他病毒的親緣關係所在的位置。Robert教授解釋,可以看出新型冠狀病毒和SARS病毒屬於同一種(Species),被稱為類SARS病毒種(SARS-like Species), 又或者叫SARS相關病毒種(SARS-related Species),英文叫法不統一,沒有國際標準。但也可以看出它們不屬於同一“簇”,2019新型冠狀病毒屬於蝙蝠-類冠狀病毒簇,SARS病毒屬於SARS簇。

國際病毒分類系統採用目、科、亞科、屬、種分類單元,2005年國際病毒命名委員會第8次分類報告,進一步明確了“種”作為病毒分類系統種的最小分類階元。確切地說,新型冠狀病毒與SARS病毒均屬於冠狀病毒科、冠狀病毒亞科、β冠狀病毒屬、類SARS冠狀病毒種。

相關資料的進化樹如上圖所示,2019年12月在武漢發現的病毒在紅框內標紅的位置,它的下方有多個以“SARS”字樣命名的病毒。

這張圖如同“族譜”,顯示了新型冠狀病毒在整個冠狀病毒家族中的位置。它的“定位”遵守冠狀病毒種類劃分的規定(只有基因組序列完整的病毒能夠使用以下標準劃分):新發現的冠狀病毒在保守結構域(ADRP、nsp5(3CLpro)、nsp12(RdRp)、nsp13(Hel)、nsp14(ExoN)、nsp15(NendoU)和nsp16(O-MT))中與已經發現的病毒有90%以上的同源性,則認為新發現的病毒屬於該物種,這是“種”的劃分標準。

可見,對於病毒的種類的劃分保守區域的同源性才是關鍵。2019新型冠狀病毒與SARS病毒的7個基因片段的同源性高於90%,根據這一標準,新型冠狀病毒與SARS病毒屬於同一個“種”。

來源:科技日報 文中圖片除注明外由作者提供

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