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Nat Microbiol:科學家在人類腸道菌群中鑒別出6000多個抗生素耐葯基因

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近日,一項刊登在國際雜誌Nature Microbiology上的研究報告中,來自伯明翰大學的科學家們通過研究利用一種創新性技術,在棲息於人類腸道中的細菌中鑒別出了數千個抗生素耐葯基因。人類機體腸道中有數以兆計的微生物,其中主要是細菌,大部分的細菌都對抗生素比較敏感,但人類腸道中也有一部分細菌會產生對抗生素耐受的機制,然而目前研究人員並沒有深入研究理解能夠介導腸道菌群對抗生素產生耐藥性的相關基因。

圖片來源:commons.wikimedia.org

這項研究中,研究人員就開發了一種新方法,其能通過對比已知的抗生素耐葯酶類和腸道菌群所產生的蛋白質的三維結構,來鑒別腸道菌群中的耐藥性基因。藉助這種方法,研究人員構建出了腸道中數百萬個基因的目錄,隨後他們發現了6000多個抗生素耐葯基因與之前在致病菌中發現的基因有很大的區別。

研究者Willem van Schaik教授說道,大部分的腸道菌群與人類宿主的關係都是無害的,然而腸道同樣也是誘發機體感染的細菌喜歡的住所,很不幸的是,這些細菌如今開始對抗生素產生耐藥性,因此我們就需要理解其誘發耐藥性的分子機制。通過將已知抗生素耐藥性蛋白的結構與人類腸道中細菌所產生的蛋白質的結構進行對比,研究人員在人類腸道中發現了數千個新型的抗生素耐葯基因,這就強調了人類腸道環境中抗生素耐葯基因的巨大多樣性。

最後研究者指出,在所鑒別出的耐藥性基因中,大部分基因都存在於一些與人類宿主之間處於無害關係的細菌中,因此其或許並不會對人類健康構成直接威脅;然而,如今抗生素的持續使用常常會導致很多耐藥性基因轉移到致病菌細胞中,這就會降低未來臨床中使用抗生素治療感染性疾病的有效性。

參考資料:

Etienne Ruppé, Amine Ghozlane, Julien Tap, et al. Prediction of the intestinal resistome by a three-dimensional structure-based method. Nature Microbiology, 2018; DOI: 10.1038/s41564-018-0292-6

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