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較真 | 新冠病毒一突變株成為世界主流病毒株,意味著什麽?

較真要點:

查證者:李雷丨中國科學院生物學博士

新冠肺炎的基本傳染數R0引發了很多討論。R0即基本傳染數,指在流行病學上,沒有外力介入,同時所有人都沒有免疫力的情況下,一個感染到某種傳染病的人,會把疾病傳染給其他多少個人的平均數。此前對於新冠肺炎的R0值估計總體上如鍾南山院士所說,是在2到3之間。但在美國CDC期刊《新興傳染病》雜誌發表的一項新的研究認為,新冠肺炎的R0值高達5.7,如此高的R0也決定了新冠肺炎屬於非常難以防禦的一種傳染病,需要加大舉措才能將其遏製。

同樣是計算得出新冠病毒的R0為5.7的美國洛斯阿拉莫斯國家實驗室(Los Alamos National Laboratory),其最近的一篇研究(未經同行評議)指出,新冠病毒之前發生過一次重要的變異,變異株成為了當前世界的主流病毒株,這也是導致新冠病毒肆虐的一個生物學因素。那麽這個結論如何得來?我們研讀一下相關內容。

一、監控發現一種特殊變異造就了世界主流病毒株

新冠疫情發生以來,科學家們對新冠病毒的基因序列檢測工作一直在進行,目前已經有幾千條序列上傳到了公共數據庫GISAID,而各地的研究人員還在不斷地上傳新的序列。不過這些序列可不是一模一樣的,而是在不斷地發生變化,也就是基因變異。這裡要解釋一下,很多時候,人們談到基因變異而色變,其實是完全沒必要的。因為基因變異是一種非常常見的自然現象,無論是外界因素還是基因複製過程本身發生的隨機錯誤,都有可能造成基因發生突變,而大部分變異本身並沒有好或者壞的影響,僅僅是一些隨機發生的過程。

對於新冠病毒來說也是一樣,新冠病毒是一種單鏈RNA病毒,RNA病毒很容易發生變異。事實上,從第一例新冠病毒基因上傳到如今,其基因組上已經有了數百個變異了。但是大部分僅僅是隨機變異,並沒有造成特別大的影響

儘管如此,我們也不可掉以輕心,因為一些特殊變異可能會造成新冠病毒本身性質的變化——這類型變異可能造成其傳播能力、致病能力發生變化,對於疫情的防控有較大的影響。鑒於此,研究人員開發出了一個序列實時比對系統,以關注病毒的變異情況。

在上述系統監控下,研究人員注意到了一個特殊的變異,那就是D614G變異。614是指病毒氨基酸序列的第614位,D614G變異通俗地講就是病毒株的第614位氨基酸由天冬氨酸(D)變成了甘氨酸(G)。那麽這個變異後的病毒株G614到底有什麽特殊之處呢?我們首先看一下流行病學上的特徵。

由上圖我們可以看到,在3月之前,全世界流行的病毒株主要是D614(橙色),但是從2月起,新的突變株G614(藍色)開始快速增加,並且迅速成為了佔世界主流的病毒株。這一情況在全世界各地都在上演。到了4月的時候,全球的主要流行病毒株一半以上是G614。

二、變異株迅速擴散到全世界的原因:基因關鍵位置突變導致病毒特性發生變化

變異後的病毒株G614從最初的小比例,迅速上升成為全世界主流病毒株,意味著其本身具備一些新的特徵。於是研究人員對該變異造成的影響進行了探究。

研究發現,D614G變異發生在新冠病毒的S蛋白區域。S蛋白就是大家看到新冠病毒表面那些凸起的地方,也是新冠病毒命名中的“冠”的來源。這些凸起對於病毒本身至關重要,S蛋白可以和我們細胞上的ACE2受體進行結合,使得我們的細胞將其當做正常物質吞入,從而發生感染,S蛋白對於新冠病毒來說就是一把開啟細胞的鑰匙。而這個D614G的變異,恰好使得S蛋白結構發生了一些變化,降低了這個蛋白的兩個亞基之間的作用力作者認為這種改變可能有兩種影響:

1、使病毒更容易和細胞發生融合,從而使傳染性增強。

2、增加ADE效應。所謂ADE效應,是指“抗體依賴增強症”(antibody-dependent enhancement)。一般情況下,我們感染了病原體後會獲得特異性免疫,且生成記憶細胞,這樣下次感染的時候免疫就會迅速激活從而發揮作用。但是有的時候,這種特異性免疫反應是有害的,那就是如果病原體發生了變異再次入侵,機體沒有辨別清楚,繼續產生之前的免疫,這種免疫對於變異後的病原體是無效或者有限的。機體不再去應對新病原體,反而會幫助其侵入宿主細胞。結果就是感染後的人,會比沒有抗體的人症狀更嚴重。結合SARS病毒的研究,作者推測這種變異可能會導致ADE效應增加(此處僅為推測,目前尚未確定新冠肺炎是否存在ADE效應)。

以上推測一定程度上在流行病學中得到了體現,比如英國謝菲爾德的病例中,到了後期,G614明顯越來越多,而且G614患者體內的病毒量要高於D614患者體內的病毒量,一定程度上意味著其病情更加嚴重,這可能與ADE效應有關。

以上流行病學的調查和分析,佐證了作者的一個推測,那就是G614變異的確是一個重大事件,它導致了病毒特性發生了變化,可能變得更容易傳播,危害性也更大,並逐漸成為世界上主要流行病毒株。

三、相比病毒變異,更需要關注防控措施以及疫苗研發

上面的變化告訴我們一個事實,那就是新冠病毒一直在變異,而某些變異可能造成病毒特性變化,從而增加其流行的可能性。但是,這並不是我們失望或者消極的理由。事實上,之前就有研究人員指出,早期在武漢,新冠病毒就曾發生過一次重大變異——病毒的祖先型S型變異成為了年輕的L型,而L型變得更加容易傳播。然而,我國通過實行隔離等有效措施,最終還是把更危險的病毒類型給壓製下去了。

如上圖,左邊,武漢的病毒類型大量變成了年輕的L型,而武漢之外,L型比例要低很多。右邊,在1月7日前,新的L型病毒比例高達96.2%,而在之後,這個比例降到了62.2%,可以說是把這個更有侵略性的L型病毒抑製住了。無論病毒如何變異,積極防疫仍是關鍵。

由於新冠疫苗研發如火如荼,很多人也將希望寄托在了疫苗身上。現在病毒的變異可能會影響到疫苗的效果,因此是一個值得關注的事情。研究者也指出,一些疫苗研究人員一直在使用在疫情早期分離出的病毒基因序列,而病毒持續發生著變異,如果基於原始病毒株進行設計藥物和疫苗,它們可能無法有效抵抗新的病毒株。

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