預印本都去哪兒了？科研成果發布平台：生物預印本bioRxiv

在生物學領域，文章即你的通行證。但發表一篇文章，至少也得三五月了。當你急需文章畢業或申請職位、基金時，一個不需要同行評審的預印本發行和存儲服務——BioRxiv——或許能幫助你，並且該服務是免費的。

撰文 | 小隱

責編 | 兮

在生物學領域，文章即你的通行證。然而，文章的發表是一個耗時耗力耗心血的過程，從投稿—送審—收到修改意見—修回—接收，少說也得有3-5個月，這還是在一次性成功的情況下。更常見的是多次修回的，拒稿重投的，耗上個一年半載甚至數年也是常事（Nature論文修回的時間不限，修個兩三年也是很常見的事情）。當你急需文章需要畢業或者申請職位或基金時，一個不需要同行評審的預印本發行和存儲服務—BioRxiv（發音為bio-archive）或許能幫助你，並且該服務是免費的。

首先簡單介紹一下BioRxiv: 它由非營利的研究和教育機構冷泉港實驗室在2013年發起並運維，將其作為一種促進學術交流的方法，目前隻接收英文手稿。由於不需要同行評審，所以耗時短。只要你的文章通過了攻擊性和/或非科學性、剽竊抄襲等基本篩查即可發表。BioRxiv不是雜誌，所以沒有影響因子。當你將手稿提交到BioRxiv後，你可以收到同行的反饋意見。手稿可以在提交雜誌之前或雜誌評審階段發布在BioRxiv上，但如果已被雜誌接收，則不應發布。在期刊正式接受文章之前，作者可以隨時通過點擊作者區域內的“提交修訂”來提交文章的修訂版本。一旦發布到biorxiv上，文章就可以引用，因此無法刪除。

BioRxiv有如下幾點優勢：1）可以盡早地公開自己的發現，當你的手稿在線發表在BioRxiv後，BioRxiv會顯示發表時間，這可以避免以下尷尬：在這漫長的投稿-發表過程中，你的競爭者捷足先登，在雜誌上發表了和你類似的發現，這可能會打亂你原來的發表計劃，轉投其他雜誌，或者再補充新的數據超越前者。而BioRxiv因為其時效快，48小時內即可顯示，可以作為先後順序的證據，或引導你和競爭者背靠背發表。2）發表在BioRxiv上的文章也可以作為申請基金或者崗位的籌碼，大多數研究資助者開始將預印本“合法化”。目前，英國醫學研究理事會、NIH以及霍華德·休斯醫學研究所都鼓勵受資助者在基金申請書中引用預印本，而不只是經過同行評議的論文。陳和祖克柏基金會（CZI）甚至要求受資助者在論文被提交給期刊的同時發表預印本。

作為當下生物領域最大的預印本發行服務，BioRxiv的流行度如何呢？哪個專業的文章發表最多呢？發表在BioRxiv上的文章最終發表在哪些雜誌上了？這些文章的引用率和下載量如何呢？明尼蘇達大學的Ran Blekhman和Richard J.Abdill就這些問題對2013-2018年11月的37,648篇文章進行了數據分析，他們發現發表在BioRxiv的文章量呈逐年逐月遞增趨勢（圖1a），下載量也成遞增趨勢（圖1b），同時選擇發表在BioRxiv的作者數目也在增加（圖1c）。其中2018年投稿數目為18,825，比之前四年的總合還多，這裡面神經科學和生物信息學方向的文章數目和比重最高，分佔一二席。單2018年10月就有2,000投稿量。下載量方面，單篇文章的下載量中位數是279，其中基因組學的單篇下載量中位數最高，為496，但由於神經科學文章量最多，使其在下載總量方面於2018年10月首次超過生物信息學。目前已有十萬六千多作者在BioRxiv上投稿，2018年新增了84,000作者。這些數據都顯示 BioRxiv越來越被認可。

圖1. BioRxiv的累積投稿量、下載量及投稿作者數目。a)投稿量的整體趨勢。b) 總下載量的整體趨勢。c)每年向BioRxiv投稿的新增作者數及總作者數。

那麽這些預印本手稿的發表情況如何呢？如果手稿已發表在雜誌上，BioRxiv網站會在文章題目下方給出手稿發表雜誌的鏈接，參照這一數據，迄今為止已有42%的文章被發表。其中進化生物學發表率最高，神經科學發表數目最多（圖2）。不過這一統計結果有個小問題，因為有些預印本在發表過程中改變了名稱，所以實際上這一數據更高，並且2017年以前上傳的預印本發表率基本上在60%以上， 2018年的發表率約為20%，拉低了平均水準，但也可以理解，畢竟2018年新上傳的手稿需要足夠時間發表。

圖2. 不同專業領域預印本發表的比例（b）和數目（c）

另一個大家比較關注的問題是：預印本都去哪兒了？發表在什麽雜誌上了呢？數據顯示這些文章最終發表在1,531種不同雜誌上，其中 Scientific Reports 發表了最多（828），其次是elife（750）和PLOS ONE（741）(圖3)。雖然數目不多，還是有預印本發在高影響因子雜誌上，如：至2018年11月，已有35篇文章發表在Cell上。那麽這些文章的發表周期如何呢？作者統計了從預印本上傳日期和雜誌發表日期的時間間隔，發現發表周期中位數是5.5個月，75%的雜誌能在8個月內發表，90%的雜誌能在一年內發表，而最長記錄是三年七個月。Nature Genetics的中位發表周期最長，約9個月；G3雜誌最短，約4個月。

圖3. 預印本的雜誌發表情況：發表在Scientific Reports、elife、PLOS One雜誌上的預印本數目最多

預印本的下載量可以表征該預印本的受關注程度。作者結合雜誌影響因子和預印本下載量發現，高下載量的文章通常也發表在高影響因子雜誌上，具有較高的正相關性（圖4）。發表在Nature Methods和Nature Genetics雜誌上的預印本單篇下載量最高，而PLOS ONE上單篇下載量最低。

圖4. 發表在不同雜誌上的預印本的單篇文章下載量。中間框顯示雜誌影響因子與其預印本中位下載量的關係。

最後作者安利了他們自己設計的Rxivist網站：https://rxivist.org/。其最大優勢是幫讀者篩選和過濾感興趣的或最受關注的文章。基於Twitter轉載量和總下載量了解興趣領域近期（Twitter）或一段時間內（總下載量）最受關注的預印本。

怎麽樣？是否也打算將你未發表的手稿先發布在bioRxiv預印本上呢？

原文鏈接：

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/515643v1

本文經授權轉載自“BioArt”。

《返樸》，致力好科普。國際著名物理學家文小剛與生物學家顏寧聯袂擔任總編，與幾十位學者組成的編委會一起，與你共同求索。關注《返樸》（微信號：fanpu2019）參與更多討論。二次轉載或合作請聯繫[email protected]。