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新冠病毒基因組演化分析和譜系劃分有重要進展

來源:科技日報

新冠病毒基因組演化分析和譜系劃分有重要進展

科技日報昆明4月5日電 (記者趙漢斌)記者5日從中國科學院昆明動物研究所獲悉,該所與國內多家研究機構合作,解析了新型冠狀病毒基因組的演化規律,提出了具有層次結構的譜系、亞譜系劃分系統。《科學通報》期刊發表了這一重要成果。

隨著感染人數增加,新冠病毒會快速發展出許多不同的株系。人類急需對這些新出現的變異進行梳理與描述,並更加精細化地展示新冠病毒在人群中的演變軌跡。

中科院昆明動物研究所呂雪梅、張亞平課題組與北京大學生命科學學院陸劍課題組、中國疾病預防控制中心譚文傑課題組等團隊合作,分析了121618個高質量病毒基因組中的單核苷酸變異,篩選出201個代表性單核苷酸變異,進而逐級劃分出130個亞譜系,繪製成完整的反映各個譜系之間親緣關係的單倍型網絡圖,同時建立了實時更新的配套網站以方便查看。

為闡明不同亞譜系病毒的流行程度是否有所不同,研究團隊依據譜系劃分系統對有具體采樣時間信息的119168個高質量病毒基因組進行劃分,分析結果顯示,在地理條件、交通運輸、文化風俗、防疫政策、超級傳播者等各種因素共同作用下,病毒譜系在不同地域間有各自獨特的分布模式。

研究團隊還收集了國內從2020年4月到2021年1月的輸入病例數據,將其在譜系劃分系統單倍型網絡上進行展示,可以為輸入型病例的來源提供推斷信息。

此項研究囊括了目前出現的絕大多數新冠基因組變異,並整理了其譜系關係,闡明各個譜系時空分布的規律,搭建出新冠病毒演化的大體框架,對理解病原體變異規律、新冠流行病學追蹤、預測病毒的演化方向有重要意義。

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