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健康:蛋白質的分子細節揭示了腎結石是如何形成的

【健康:蛋白質的分子細節揭示了腎結石是如何形成的】

導語:研究人員利用2017年諾貝爾獎得主的低溫電子顯微鏡技術,捕捉到一種名為TRPV5的離子通道蛋白的高解析度影像。TRPV5可以清除尿液中的鈣。

腎結石是一種固體顆粒狀的沙礫,當尿液中含有過多的鈣等礦物質時就會形成。腎結石會襲擊男人、女人,而且越來越多的兒童,結石的存在和疼痛折磨著全球12%以上的人口。使用2017年諾貝爾獎得主低溫電子顯微鏡技術(低溫電子顯微鏡)來捕獲離子通道蛋白的高解析度影像,稱為TRPV5,清除血液中的鈣尿,佩雷爾曼醫學院的研究人員在賓夕法尼亞大學、羅格斯大學醫學院和天普大學,發現了新的線索如何腎結石形成。

通過從TRPV5的分子結構中獲得的新資訊,研究人員現在能夠使用生物資訊學來發現與TRPV5相互作用的化合物,從而在高危人群中治療和預防腎結石。研究小組在《自然通訊》雜誌上發表了他們的發現。由Vera Moiseenkova-Bell博士長官的研究小組在開放和封閉狀態下捕獲了TRPV5離子通道蛋白的影像。所有細胞的外膜都有通道,允許鈉、鉀或鈣等小離子的流動。這種雙向運動在很多方面都有幫助,例如,觸發免疫反應、腦細胞之間的交流和腎臟的過濾。

近99%的鈣被腎小管重新吸收,而TRPV5僅在尿中維持鈣水準的小管中產生。大多數腎結石都含有鈣,而尿液中過多的鈣會使人容易形成這些疼痛的沉澱物。Cryo-EM利用電子束對單個冷凍蛋白分子進行數千次快照拍攝。然後,演算法結合多個影像來銳化分子結構的整體影像。通過這些影像,賓夕法尼亞貝克曼冷凍電子顯微鏡中心主任Moiseenkova-Bell和她的團隊揭示了TRPV5結構,以回答有關蛋白質在疾病中的生理作用的問題。

「我們第一次看到了這種蛋白質是如何通過激活膜脂來打開的,」共同第一作者Taylor Hughes說,他是Moiseenkova-Bell實驗室的研究生。「許多蛋白質的調節方式類似,所以我們的結構為理解這一過程奠定了基礎。」博士後研究員、共同第一作者Ruth Pumroy博士補充說,研究小組還發現,在存在一種叫calmodulin的蛋白質的情況下,一個封閉通道的結構可以直接堵塞通道的孔隙,而不會引起孔隙移動。「這揭示了TRPV5抑製的一種獨特機制,這可能對發現新的結合夥伴和藥物發現有用,」Pumroy說。

總結:羅格斯大學的共同作者Tibor Rohacs和他實驗室的研究生Aysenur Yazici,通過改變TRPV5結構中的單個氨基酸來驗證鈣通道如何工作的預測,以觀察鈣通過改變通道的流動是否會不同。當與TPRV5結構中的脂質接觸的氨基酸發生改變時,TRPV5不允許鈣流入細胞。當另一個TPRV5氨基酸在通道中改變時,鈣調蛋白的抑製作用消失。坦普爾大學的合作者使用複雜的電腦程式進一步證實了這一發現。

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