科技快遞丨過敏反應或可抵禦皮膚癌

科研進展

1、兩篇Cell揭示與侵襲性轉移攝護腺癌相關的遺傳變異

GWAS研究發現基因組19號染色體長臂（19q13）的易感性多態位點rs11672691與侵襲性攝護腺癌（PCa）相關。《Cell》，芬蘭奧盧大學研究人員在一組涉及2738例PCa患者隊列中獨立證實了該發現，19q13惡性攝護腺癌易感多態性位點rs11672691與兩種候選基因PCAT19和CEACAM21的轉錄水準升高有關，參與PCa細胞生長和腫瘤進程發展。機制研究表明，rs11672691位於增強子元件中並改變HOXA2（致癌轉錄因子）的結合位點。CRISPR / Cas9介導的單核苷酸編輯顯示出rs11672691對PCAT19和CEACAM21表達，以及PCa細胞侵襲性表型的直接作用。臨床數據也證實了rs11672691基因型和PCAT19 / CEACAM21基因表達對PCa預後的協同作用。該研究為rs11672691與侵襲性PCa的相關性提供了合理的生物學機制研究。《Cell》另一篇獨立研究，加州大學舊金山分校研究人員對來自101名轉移性去勢抵抗性攝護腺癌患者樣本進行全基因組和轉錄組深度測序分析，發現了大量結構變異，這些結構變異可影響腫瘤發生和進展的關鍵調節因子。其中，在81％的患者中觀察到雄激素受體（AR）基因上遊有624kb基因間增強子區域的擴增，進而導致AR表達升高; 85％的樣本具有致病性激活AR突變AR擴增或假定的AR增強子區域擴增。該研究提供了結構變異如何影響轉移性攝護腺癌中關鍵調節因子的綜合性觀點。

https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(18)30728-1

https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(18)30842-0

2、Nature子刊：過敏反應或可抵禦皮膚癌

《Nature Immunology》，倫敦帝國理工學院一項研究表明，引發過敏反應的免疫系統成分也可能有助於保護皮膚免受癌症的侵害。IgE抗體可防止皮膚暴露在促腫瘤化學物質或紫外線照射下所造成的損害，並有助於對抗皮膚癌。通過研究12例鱗狀細胞癌患者的皮膚腫瘤，結果顯示，所有腫瘤中都含有IgE，其中一些腫瘤比其他腫瘤更具侵襲性。進一步分析後顯示，危險性較低或「低風險」的腫瘤含有較多的IgE攜帶細胞，而較嚴重的腫瘤含有較少的IgE攜帶細胞，這表明IgE可能對癌症的發展提供某種保護作用。未來將找出IgE如何阻止皮膚細胞癌變，並是否能以某種方式操縱過敏反應，以預防或治療皮膚癌。

3、長讀長測序揭示乳腺癌細胞系中複雜重排和癌基因擴增

SK-BR-3細胞系是HER2 +乳腺癌最重要的模型之一，該種乳腺癌可影響1/5的乳腺癌患者。該細胞系發生高度重排，很多變異發生在複雜和重複區域。《Genome Research》，研究人員利用PacBio長讀長單分子測序對SK-BR-3進行研究，構建其基因組結構變異圖譜，包括近20000個結構變異變異，其中大多數都是短讀長所遺漏的。另外，在ERBB2致癌基因（也稱為HER2）周圍發現一系列複雜DNA變異。全長轉錄組測序進一步揭示了基因組變異內的幾種新基因融合。結合長讀長測序，可深入分析結構變異如何破壞基因組，並揭示癌症基因組進化中涉及的複雜機制。

https://genome.cshlp.org/content/early/2018/07/13/gr.231100.117.abstract?sid=36b9e206-3c46-4ef5-96ba-35d8cdb1e331

4、DNA甲基化和基因表達整合分析揭示肝細胞癌特異性診斷生物標誌物

肝細胞癌（HCC）中可經常觀察到DNA甲基化改變，並可能在癌症發生和診斷中起重要作用。《Genome Medicine》，中科院上海生命科學研究院營養與健康研究院研究人員通過比較375個肝癌患者組織、50個正常肝組織、184個健康人血液以及3780個患其它癌症患者的甲基化圖譜，篩選出了HCC中特異性甲基化位點。進一步通過Logistic回歸模型建立肝癌預測模型，對三套獨立數據集（327個HCC和122個正常樣本）和10個新收集活組織樣本進行評估，鑒定了一組具有CpG島甲基化表型（CIMP）的患者，並發現CIMP患者的總生存率低於非CIMP患者。此外，研究人員鑒定了6個HCC特異性高甲基化位點可作為潛在的診斷生物標誌物，6個位點聯合肝癌預測模型對肝癌的預測靈敏度達到92%，並能排除98%的正常肝組織和其它類型的癌症。該研究系統描述了肝癌的DNA甲基化特徵，為肝癌的診斷提供了有治療前景的生物標誌物。

1、澳大利亞基因組癌症醫學計劃獲政府5000萬澳元資助

澳大利亞Garvan醫學研究所表示，澳大利亞基因組癌症醫學計劃已獲澳大利亞政府5000萬澳元（3660萬美元）資助。該計劃由Garvan研究所發起，將罕見病和非常見癌症患者的基因組資訊與治療相匹配。通過新的五年資助，澳大利亞患有罕見或不常見癌症的患者可通過由Garvan研究所長官的八個癌症中心網路而進入該計劃。該計劃通過其分子篩選和治療（MoST）臨床試驗，在比較腫瘤和種系基因組後，將癌症患者與靶向治療相匹配。

https://www.genomeweb.com/cancer/garvan-institutes-australian-genomic-cancer-medicine-program-receives-a50m-government-funding#.W1ES6PkzbIU

2、比爾蓋茨等捐贈3000萬美元資助阿爾茨海默症診斷研究

據報導，比爾蓋茨等一眾慈善家及慈善機構合作，捐贈3000萬美元投入用於診斷阿爾茨海默氏症的診斷加速器，用於激勵阿爾茨海默氏症診斷檢測的開發。

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