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1 小時內快速檢測新冠病毒,麻省理工張鋒團隊開發出新方法

2019 年底至今爆發的新型冠狀病毒(COVID-19)給全球公共衛生帶來了巨大挑戰。

為緩解這一困境,來自麻省理工學院和哈佛 Broad 研究所、麥戈文腦科學研究所的一支團隊開發出了一種新的 COVID-19 檢測方法,能在 1 個小時內完成檢測。作者包括著名 CRISPR 大牛張鋒教授,相關研究成果已經提交到 bioRxiv。

但需要指出,由於這項技術仍處於非常初步的階段,還未在真實患者樣本中進行檢測,因此團隊也強調,這種方法目前不能用於臨床上對 COVID-19 的診斷。

該方法基於 CRISPR,利用了張鋒團隊此前開發的 SHERLOCK 技術,可以快速檢測新冠病毒 RNA。

根據 DeepTech 此前報導,實驗證實,基於 CRISPR-Cas13 的 SHERLOCK 技術,在多種人類樣本(如唾液)中發現寨卡、登革熱等病毒的 RNA 序列,甚至一些與癌症突變相關的序列。其對 RNA 和 DNA 的檢測靈敏度都達到了單分子級。

而且,張鋒團隊還為更好地使用 SHERLOCK 開發了類似於驗孕棒一樣的試紙檢測方法:不需要任何特殊設備,只需一張試紙,SHERLOCK 就能顯示出病毒感染檢測結果,非常易於使用。

用在 COVID-19 的檢測中,張鋒團隊設計了能與新冠病毒特異性結合的 RNA。一種 RNA 識別 COVID-19 的 S 基因,另一種 RNA 則識別 Orf1ab 基因。

在 RNA 找到新冠病毒後,RNA 上綁著的強力剪切酶(Cas13a)就會被釋放,切斷 RNA 物質。與此同時,他們加入了一種目標 RNA,以判斷該剪切酶是否被釋放,RNA被剪斷與否則用試紙來檢測。因此該技術只需 1 小時就能判斷是否存在新冠病毒。

具體的檢測方案有以下三個步驟,適用於為 qPCR 檢測提取的 RNA 樣本:

1. 將提取的 RNA 進行等溫擴增反應,42°C 下孵育 25 分鐘;

2. 步驟 1 反應物加入 Cas13 蛋白、兩種設計的 RNA,37°C 孵育 30 分鐘;

3. 將試紙條浸入步驟 2 的反應體系中,等待反應 2 分鐘。

研究團隊表示,該檢測方法仍需進一步的優化、測試和臨床驗證,以開發出用於檢測 COVID-19 患者樣本中新型冠狀病毒的簡單系統。同時,研究團隊將為任何有興趣進一步開發和使用此技術的組織免費提供可能有用的信息和技術支持,包括共享可能支持潛在診斷開發的信息。

-End-

參考:

A protocol for detection of COVID-19 using CRISPR diagnostics

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