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華南海鮮市場測序分析:早期案例並不都出於此,病毒源頭或更複雜

(人民日報健康客戶端記者 尹薇)當地時間2020年3月27日,雪梨大學生命與環境科學學院、醫學科學學院愛德華·霍爾姆斯(Edward Holmes)教授和上海市公共衛生臨床中心、複旦大學生命科學學院張永振教授聯合在《細胞》(CELL)雜誌上發表一篇評論“A Genomic Perspective on the Origin and Emergence of SARS-CoV-2”。

該評論通過系統梳理目前所知的各項研究中關於新型冠狀病毒出現的基因組數據後,就現有成果總結認為:“從武漢華南海鮮市場上采集的‘環境樣本’的基因組序列現已被獲取,據進化分析顯示,它們與從武漢最早的病人身上采集的病毒非常接近”。但霍爾姆斯教授和張永振教授同時指出,由於“並非所有的早期COVID19案例都與該市場有關,因此病毒源頭可能比最初猜測的更複雜”。該評論認為,尚不清楚樣本是否來自經過市場的感染者還是源自該地點的動物。但對該市場目前已經缺少明顯直接的動物采樣,這意味著做出判斷將很困難。

張永振教授團隊是世界上最早發布新型冠狀病毒全基因組序列的研究團隊。在全球6000多種病毒中,張永振團隊就發現了2000多種。他所在的上海市公共衛生臨床中心團隊在2020年1月5日凌晨就從武漢華南海鮮市場的一名病人身上送檢的標本中檢測出一種全新的冠狀病毒,並通過高通量測序獲得了該病毒的全基因組序列。並於1月11日發布,團隊在《病毒學組織》網站發布了所獲得的新型冠狀病毒全基因組序列。

而另一位參與該文的學者、來自雪梨大學的霍爾姆斯教授則是一名進化病毒學方面的專家,他致力於持續與中國和世界各地的科學家密切合作,以解開引發COVID19的新型冠狀病毒的遺傳密碼,追溯它的起源,從而幫助其他科學家尋找有效疫苗。他們的工作還將有助於監測和預防其它可能從野生動物傳播到人類體內的病毒,引發“人畜共通傳染病”。

目前為止,霍爾姆斯已經與其他學者合著了四篇關於新型冠狀病毒的論文,其中包括兩篇最早對這種病毒的描述(分別發表在《自然》和《柳葉刀》等雜誌上)。這周,他又發表了兩篇新論文。《自然》雜誌在經過同行評審後,於本周四(3月26日)提前發表了其中一篇論文,確認了一種來自中國南部地區馬來亞穿山甲所攜帶的病毒與感染人類的冠狀病毒類似。因此推論穿山甲可能是新出現的人類病毒的中間宿主。作者呼籲應禁止這些動物和其它動物在菜市場流通,以防止人畜共通傳染病傳播給人類。管軼為該文通訊作者,而霍爾姆斯教授是作者中唯一一位非中國籍的學者。

就在上周,《自然醫學》雜誌也發表了霍爾姆斯教授與加州拉荷亞Scripps研究所、愛丁堡大學等科學家們共同撰寫的論文。該文通過對基因組數據的比較分析指出,新型冠狀病毒不是實驗室產物,也不是一種被故意操縱的病毒,從而否認了那些認為新型冠狀病毒是人造生物製劑的猜測。根據Altmetric公司的數據,這篇論文迅速成為有史以來排名最高的學術研究。“這充分表明了全球對這一話題的關注”霍爾姆斯教授指出。

最新這篇文章,結合科學研究成果,也結合時下很多認知進行了評點,為學術研究和大眾關切問題架起了一座橋梁。“了解新型冠狀病毒轉移到人類身上的進化途徑,不僅有助於我們對抗當前的疫情,而且能幫助我們辨別來自其它物種的冠狀病毒的威脅。該論文便是解決這一難題的重要組成部分。”

該文章總結道,新型冠狀病毒很可能成為人類第5種地方性冠狀病毒。“冠狀病毒顯然有能力跨越物種界限,適應新的宿主,這讓我們更直接的預測未來會出現更多的冠狀病毒”。因此人類需要更多的研究來幫助制定公共衛生政策,以應對類似病毒的出現。

該文指出,政策和其它相關措施有助於防止其它冠狀病毒對人類健康構成威脅,這包括:

1、監測多種哺乳類動物的冠狀病毒。眾所周知,蝙蝠攜帶許多冠狀病毒,我們對其它物種攜帶這些病毒以及哪些病毒有可能出現在人類身上知之甚少。

2、加強打擊非法販賣野生動物的行動。

3、禁止菜市場銷售哺乳動物或鳥類野生動物。

“顯然野生動物體內含有很多冠狀病毒,這些病毒有可能感染人體。這次疫情爆發的一個重要教訓是:人類必須減少與野生動物的接觸,例如禁止野生動物貿易。”霍爾姆斯教授說道。

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