首先，是《神盾局特工》前五季回顧，涉及微量劇透，尚未觀看又有計劃觀看的觀眾，請謹慎收看。
第一季：複聯外傳
在《復仇者聯盟》中不幸犧牲的寇森特工毫無預兆地復活，他如何復活也成為了劇集的第一個大坑。
復活後的寇森組建了自己的一支神盾小隊，成員包括：
科學雙人組菲茲和西蒙斯；
第一女打手梅姨，第一男打手沃德；
半路“撿來”的黑客斯凱；
第一季播出的時候漫威影業還沒有獨立，而且劇集也需要MCU電影來帶熱度，加上《復仇者聯盟》導演喬斯·韋登還親自執導，所以與電影的聯動相當緊密。
上半部分寇森小隊主要應對《鋼鐵俠3》裡出現的絕境病毒，中間在揭開寇森的復活之謎後，下半部分轉入了《美國隊長2》神盾局淪陷的劇情。幾位電影角色都登場亮相，《雷神》希芙和《複聯》希爾特工的戲份都不少，神盾局局長尼克·弗瑞在最後一集客串出現，漫威對劇集的重視程度可想而知。
第二季：“震波女”成長記
第二季開始延續神盾局與九頭蛇的鬥爭，然後通過一塊神秘方尖碑，逐漸切入到“異人族”，以及斯凱的身世之謎。
在梅姨的指導下，斯凱從一個黑客慢慢轉型成打手，這一季她的戲份遠大於寇森。最後，她找回了自己的身世，並擁有了超能力，原來她的名字叫做黛西·約翰遜，也就是漫畫裡的“震波女”。找到身份認同後，她讓別人不要再叫她斯凱，而是叫黛西。
喬斯·韋登仍然是劇集的總導演，漫威再次展示了超強的角色塑造能力。黛西成長為一名真正的特工，寇森從不那麽自信地接過局長的位置，到一統分裂成兩派的地下神盾局（期間還與《複聯2》大聯動，洛基權杖的下落就是寇森調查出來的）。還有其他幾位配角的個性、能力都能做得鮮明獨特，這是整個系列都能保持高評分的關鍵之一。
第三季：九頭蛇起源之謎
“科學組”兩人再度被拆散，菲茲展開拯救西蒙斯的計劃，沒想到其中卻關聯到九頭蛇的起源之謎。
原來九頭蛇的起源比紅骷髏更早，沃德成為新的九頭蛇核心戰力，他要完成九頭蛇組織成立的根本目的。
最後沃德與寇森小隊的新仇舊恨一起清算，九頭蛇到這裡算是徹底瓦解了。
第四季：惡靈騎士與AI機器人
第四季上半部分聚焦惡靈騎士，下半部分變成了AI機器人艾達的危機。神盾局在這中間再次回歸到公眾視線，關鍵道具“黑暗之書”被認為是《奇異博士》裡失竊的那本書，艾達在看完書後所使用的“特效”也與電影十分相似。
這時漫威影業已經獨立，電視劇的劇情基本與複聯故事脫離，自己玩自己的了。好在一眾角色已經塑造成型，粉絲們有理由繼續關注他們的故事。
第五季：時間穿越
沒有了與電影聯動的“負擔”，第五季編劇們徹底放飛自我。
承接第四季結束寇森小隊被神秘人綁架，他們直接來到了外太空，看到了被炸成粉碎的地球。
他們來到了（一個）遙遠的2091年，克裡人成為了幸存人類的統治者。這回拯救人類的不再是復仇者，而是神盾局特工。
回到過去之後，不知是為了蹭熱度還是幫助宣傳，劇情還強行和《複聯3》進行了互動。
實際上滅霸和特工們沒有半毛錢關係，因為他們口中的滅霸並不一定是《複聯3》裡的滅霸。具體後面詳細討論。
第六季開播：寇森小隊已離開MCU世界？
第五季的腦洞打得太開，導致很多關於漫威宇宙的設定都越發模糊。
第六季的《神盾局特工》已經不再和電影那邊有關，第一集開始的時候，滅霸的響指事件似乎壓根沒發生。
第五季結局講到寇森終於耗盡了自己的生命，梅姨陪他走完了最後的旅程。西蒙斯和黛西去尋找仍然被冰封在太空的菲茲。
一找就是一年。
按照滅霸大軍進攻地球（瓦甘達）的時間線來說，第五季的結局應該是剛好在《複聯3》爆發“無限戰爭”的時候，《蟻人2》的故事也幾乎在同一時間進行。
那麽梅姨和寇森享受最後的時光之時，地球就已經消失了一半人口，寇森小隊也難免受到波及。
也許是為了避免響指事件的“干擾”，編劇直接把故事時間推到了一年之後，但卻還是和《複聯4》的設定產生了衝突。
復仇者並沒有在一年時間內解決滅霸的問題，這時候的地球仍然消失一半人口，情況應該是相當混亂，光處理各種亂子都有神盾局受的了。更何況寇森的接班人才剛剛上任成為新局長，還需要時間去建立威望。
只能說，第六季籌備拍攝的時候《複聯4》的劇情還在嚴格保密之中，就連電影的很多演員都不知道劇情，更何況是已經“分家”的電視劇部門。在不知道《複聯4》劇情的情況下，編劇要想在不和電影設定衝突的情況下寫新的故事，也只好把時間推後，只是他們沒想到推地還不夠後。
好在新的故事足以讓觀眾暫時忘記邏輯上的不通，失去了寇森的寇森小隊要面臨兩個全新的危機，懸念在第一集就鋪設地非常出色。
兩個危機分成了兩條故事線，寇森小隊也分成了兩組人馬。
西蒙斯和黛西帶領一隊人馬去外太空尋找菲茲；邁克和YOYO並沒有一起去，而是留在地球，負責神盾局的事務。
5月10日開播後，豆瓣開出9.1的高分，媲美第五季的高分開局。
寇森小隊從未來回來後，菲茲仍然冰凍在宇宙當中。也就是說，在同一個時間點，曾經存在兩個菲茲。美國隊長的問題同樣道理，他決定回到過去生活，（就算是在另一個平行宇宙）也存在兩個自己。
不知道是不是受到了蝴蝶效應的影響，原先成功冰凍到2091年的菲茲，這次他的飛船被炸掉了。看到太空戲的特效就知道這一季為什麽只有13集了（往年的一半），第一集的經費估計已經花得七七八八。
西蒙斯和黛西一路追尋失蹤飛船的下落，她們的“和風”戰機也不知道從哪裡得到了類似銀護飛船的“跳躍”功能，可以確定她們已經離開了太陽系。
“震波女”黛西在外太空的旅程中還創出了一番名堂，她的名號令到外星人聞風喪膽。
西蒙斯又換了個新髮型，一年時間她學會了外星語言，她無疑是堅決要找到自己的丈夫菲茲，可是他們的飛船已經難以堅持，隊員們折兵損將，小隊只剩下4個人，疲憊不堪。
就連共患難多年的黛西也覺得應該回地球，西蒙斯如果執意堅持，團隊內部將會出現內亂。
找回菲茲應該是肯定的，可能編劇覺得，不虐一下科學組，就不是《神盾局特工》了。
地球這邊，陪伴完寇森的梅姨歸隊協助邁克，他們帶領的新神盾局不用處理滅霸的麻煩，而是面臨神秘穿越人物的威脅。
疑似從另一個平行宇宙穿越過來了一隊人馬，他們要執行某種任務。具體是什麽目的，成為了前期劇情的一大懸念。
偵測到異常的神盾局不能坐視不管，面對作風凶狠的神秘團夥，沒有了最強戰力黛西，又沒有了科學組的最強智商，邁克、梅姨、YOYO三個老角色面臨著前所未有的挑戰。
回到有關MCU世界設定的問題上，本來《神盾局特工》和22部MCU電影是共享世界觀的，尤其是前面兩季還和電影的連結如此緊密，與奈飛那邊“捍衛者聯盟”的情況是不一樣的。
照慣例，《神盾局特工》第六季應當就是《複聯4》之後的故事。
可現在劇情當滅霸的事情沒有發生過，邏輯上不是說不通了嗎？難道寇森壓根沒有復活過，這是另一個平行宇宙裡的故事？
其實也能說得通。
按照羅素兄弟“穿越就會創造新時間線”的說法，在MCU世界裡進行時間穿越，並不會改變原來時間線的既定軌跡，而是會創造一個平行宇宙。
也就是說，寇森一夥在穿越到未來的時候，其實是去了另一個平行宇宙，而不是還在原來的時間線。等他們回到過去，又創造了一個新的平行宇宙。
在這個新的平行宇宙，滅霸雖然也來了，但很快就被打敗，所以響指根本沒打著。
等於說，早在第五季，寇森小隊就已經離開了原來的MCU時間線。既然《複聯4》打開了平行宇宙，如此理解也未嘗不可。
這樣編劇就舒服多了，管你滅霸和複聯怎麽打個天翻地覆，反正現在與《神盾局特工》無關。
現在，他們要開始書寫一個隻屬於自己的故事。
第六季還給了粉絲一個小小的驚喜，那就是靈魂人物寇森特工還是回來了，不只是他的精神延續，他整個人都回來了。而飾演他的克拉克·格雷格不僅是主演，還升格成為了導演。
他以意想不到，又預料之中的方式回歸。當然肯定不是《驚奇隊長》那樣的方式。
只能說，有了平行宇宙的設定，真的可以為所欲為。
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