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較真丨研究稱西班牙從去年3月的廢水中檢測出新冠病毒,說明了什麽?

較真要點:

查證者:VC | 病原生物學博士,科普作者

前幾日,“西班牙從去年3月的廢水樣本中檢出新冠病毒”的報導引發了眾多討論,許多人認為,這意味著早在去年3月新冠病毒就在西班牙本地傳播了。這個消息是由一篇發表在MedRxiv上的預印本文章引爆的,相關研究由巴塞隆納大學腸道病毒小組進行。

一、研究從巴塞隆納去年的廢水樣本中檢出RdRp兩個片段呈陽性

作者研究的對象是西班牙巴塞隆納地區兩個汙水處理廠的汙水樣本。從2020年4月13日至5月25日,研究人員每周會分析兩個汙水處理廠的樣本,檢測其中是否存在新冠病毒。並且還對汙水處理廠2保存的更早的冷凍存儲汙水樣本進行了檢測,這些樣本的分布時間是2018年1月至3月;2019年1月、3月和9月至12月,以及2020年的1月至3月。

具體的實驗操作,首先是對800毫升的汙水進行聚乙二醇(PEG)沉澱——PEG沉澱法是指在一定鹽濃度條件下向溶液加入親水性極強的聚乙二醇引起大分子溶質的凝聚沉澱的方法, 1970年代最早開始用於噬菌體(細菌病毒)的純化。目前,PEG沉澱還在實驗室中廣泛用於病毒的純化,比如慢病毒初步純化、擴增病毒的初步純化等等。病毒在這種低溫、高鹽環境中緩慢沉澱,可以避免發生化學和物理的變性。

將經PEG沉澱的樣本濃縮後提取其中的核酸,並針對新冠病毒的RdRp基因、E基因和N基因進行檢測,

出人意料的發現在於冷凍樣本的檢測結果——研究者對2020年1月15日至3月4日的樣本進行檢測,並在1月15日的樣本中檢測到了新冠病毒,這個時間比當地第一例病例確診的時間(2020年2月25日)要提前一個月以上,側面說明汙水的檢測可能能夠反映疫情的開始和進展。

這篇文章最大的爭議在於另一檢測結果,也就是各媒體報導的“從去年3月的廢水樣本中檢出新冠病毒”。研究者認為在2020年之前,可能有新冠肺炎患者被認為是流感病例而被“掩蓋,於是又分析了 2018年1月至2019年12月的冷凍樣本,結果在2019年3月12日的樣本中檢測出RdRp基因的IP2和 IP4片段靶點為陽性,如下圖紅框處所示:

作者認為表格中的結果顯示:“2019年3月12日的樣本檢測IP2和IP4片段都是陽性。除此樣本外,其余時間點的都是陰性。”而作者下結論也非常倉促:這一結果暗示巴塞隆納在世界疫情蔓延前就出現了病毒的傳播。

二、研究結果並不足以說明“去年3月新冠病毒就在巴塞隆納傳播”

隻憑RdRp基因兩個片段陽性這一個孤立的結果來下“巴塞隆納在世界疫情蔓延前就出現了病毒的循環”這樣的判斷,作者的做法非常不嚴謹。

一般情況下,實驗中出現這樣孤立的結果,第一反應都是——是不是實驗流程哪裡出錯了?對於2019年3月12日的這個陽性結果,最可能的影響因素是實驗過程中操作可能發生了汙染。這個汙染發生的環節可能有多個,比如濃縮樣本以及核酸檢測時實驗體系的配製等等。

此外,作者並未提交實驗中擴增出的病毒基因序列。僅僅是RdRp基因的兩個片段檢測呈陽性,同一時間點E基因和N基因並沒有檢測出來,所以擴增出的RdRp基因的兩個片段到底是不是新冠病毒的序列,還不能下判斷。由於沒有序列信息,不能排除當時的廢水裡有與新冠病毒RdRp序列很接近的其他冠狀病毒的存在。

更進一步,如果檢測到的真的是新冠病毒,按照作者結論裡關於巴塞隆納的描述——“巴塞隆納是一個商貿中心,也是舉辦大型活動的熱門地點,這裡聚集了來自世界各地的遊客。而隨著未被注意到的新冠病例的傳播,類似巴塞隆納這樣的情況很有可能在世界的其他地方也發生了。”那麽這個病毒當時首先應該在巴塞隆納傳播開來,隨後輸入到全球各地。而且按照新冠病毒的重症率和病死率,當地的醫療機構不可能發現不了這個情況,更不可能在武漢出現疫情之後才“後知後覺”。

對於該研究,西班牙公共衛生與衛生行政管理協會的瓊·拉蒙·比利亞比(Joan Ramon Villalbi)博士也表示,當前只是一個項目的研究結果,要進一步證實才能得出一個明確的結論,我們唯有參照更多的數據、更多的研究、更多的樣品,來確認並排除該實驗室的錯誤或方法學漏洞問題。”

綜上,文章提供了一個從城市廢水的角度監測新冠流行情況的方法。但是最後僅憑一個冷凍廢水樣本的孤立結果得出的結論幾乎不能成立。

本文編輯:leannaliu

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