數據顯示，目前按照國內指南，採用正規Hp四聯療法（雙倍劑量質子泵抑製劑+兩個抗生素+鉍劑），並且抗生素也按指南推薦（阿莫西林、克拉黴素、呋喃唑酮、左氧氟沙星、四環素、甲硝唑）選用，Hp根除率也還在50%～90%，可以看到數據並不容樂觀，仍有很大部分患者會出現根除失敗的現象。且研究發現，在幽門螺桿菌的根除率上，復治者比初治者明顯下降，同樣的治療方案，隨著時間的推移，根除率逐步降低。
其中，對抗生素的耐藥性是造成治療失敗的主要因素。另外，一些患者用藥數天后癥狀改善，便麻痹大意，不按時足量、足療程堅持用藥，導致未能徹底清除。而未忌口，也是不可忽視的因素，治療期間應禁止吸煙喝酒、避免辛辣、不新鮮、生冷等刺激性食物，以及會降低藥效的酸性食品(如優酪乳)。
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除此之外，根除幽門螺桿菌前應先注意口腔衛生。由於幽門螺桿菌大多情況下能引起胃部疾病，所以目前所有的檢測方法都只針對胃內的幽門螺桿菌，而忽視了幽門螺桿菌的另外一個聚居點——口腔。進而導致，胃內幽門螺桿菌被殺滅後，口腔中的幽門螺桿菌還會源源不斷地流入胃部，這就是目前胃病反覆，久治不愈的原因。
所以，對於幽門螺桿菌，在根治胃部的同時，一定要對口腔進行診斷和治療。當口腔出現明顯異味或難以治癒的潰瘍時，就需引起警惕，及時清除口腔Hp的清除。
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對於口腔幽門螺桿菌，雖然抗生素藥物對其無計可施，但是，只要找到突破口，想要將其剿滅並不難。Hp在口腔主要生存於牙菌斑中，牙菌斑獨特的微生物「生物膜」結構，是導致根除失敗的主要原因。而只要利用專業的清幽牙膏，從擊破牙菌斑入手即可。解決完牙菌斑，牙膏還可通過發揮其生物活性成分的強大力量，搶奪病菌生存所必需的鐵離子，以及對其細胞壁的溶解，多方面共同作用，將口腔幽門螺桿菌一網打盡。
想要徹底遠離幽門螺桿菌，僅靠單一的抗生素治療是遠不夠的，考慮到後期再根除成功率的降低，盡最大可能防止其複發，保證一次根除成功是最明智的選擇。
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